Autoriai sukūrė mini antikūnus naudodami programinę įrangą, kuri numato, kaip tai padaryti
Tai labai nuostabus dalykas! Tai atveria daug galimybių.
Stephenas Mayo, Caltech chemikas
Antikūnai gerai jungiasi su baltymais, pvz.su skirtingais mikrobais. Todėl farmacijos įmonės juos naudoja kaip vaistus kovojant su infekcijomis ir vėžiu. Tačiau antikūnai yra dideli baltymai, todėl juos brangu gaminti, o procesas dažnai būna nestabilus. Tyrimo autoriai stengėsi išspręsti šias problemas.
Procesas, kurio metu antikūnai jungiasi prie taikinioatrodo kaip alpinistas, bandantis įkopti į uolą, aiškina Vašingtono universiteto (UW) skaičiavimo struktūrų biologas Davidas Bakeris. Tokios uolos paviršius dažniausiai būna lygus, rankų ir kojų atrama mažai. Antikūnai yra dideli, todėl vienu metu gali sugriebti daug ir tvirtai laikytis.
Tačiau mini antikūnai turi mažiau galimybių.Tyrėjai bandė įveikti šį trūkumą, jie nustatė baltymų surinkimo vietas ir pagal tai sukūrė mini antikūnus. Bet tai tinka tik gerai ištirtiems baltymams.
Norėdami išspręsti šią problemą, Bakeris ir kolegoskreipėsi į Rosetta programinę įrangą, kurią jie sukūrė, kad prognozuotų baltymų struktūras pagal jų aminorūgščių seką. Siekdama sukurti galimų atramų žemėlapį, komanda pavedė programai apskaičiuoti, kaip tiksliai apibrėžtos aminorūgštys jungsis prie įvairių tikslinio baltymo paviršiaus taškų. Tyrėjai naudojo Rosetta kurdami dešimtis tūkstančių virtualių mini antikūnų.
Ši programinė įranga leismokslininkai sukurti diagnostinius zondus, padedančius ankstyvoje stadijoje aptikti ligas, priduria Kalifornijos universiteto San Franciske bioinžinierė Tanya Kortemme.
Mes galime sukurti baltymussusisiekti su bet kuriuo taikiniu. Tai reiškia, kad miniproteinai gali ne tik blokuoti ligas sukeliančius baltymus, bet ir nukreipti vaistus į vėžinius audinius arba pristatyti šviesą skleidžiančias ar radioaktyvias diagnostines molekules į bet kurias ląsteles. Tai padės stebėti gydymo eigą.
Longxin Cao, UW postdoc
Skaityti daugiau:
„Penktasis elementas“ egzistuoja: naujas eksperimentas patvirtins, kad informacija yra reikšminga
„James Webb“ padarė ryškiausią žvaigždės nuotrauką istorijoje
Kvantinis įkrovimas leis rekordiškai greitai įkrauti elektromobilius