Projekte naudojamas Perturb-seq metodas, leidžiantis stebėti įjungimo arba išjungimo poveikį
Dirbant su Perturb-seq technologijatyrėjai atlieka genetinius ląstelių pokyčius naudodami CRISPR-Cas9 ir tada naudoja vienos ląstelės RNR seką, kad surinktų informaciją apie RNR, kuri yra išreikšta dėl to genetinio pokyčio. Tyrėjai pažymi, kad RNR kontroliuoja kiekvieną ląstelių elgesio aspektą, todėl šis metodas padeda iššifruoti daugumą minimalių genetinių pokyčių ląstelinio poveikio.
Naujame tyrime mokslininkai naudojožmogaus kraujo vėžio ląstelių linijas, taip pat iš tinklainės gautas ne vėžines ląsteles, atlikti Perturb-seq daugiau nei 2,5 mln. Remdamiesi gautais duomenimis, genetikai sukūrė išsamų žemėlapį, susiejantį genotipus su fenotipais.
Autoriai mano, kad projekto rezultatai padėsbūsimi tyrimai. Pavyzdžiui, patys integruoto žemėlapio kūrėjai naudojo duomenis tirdami nežinomų funkcijų genų poveikį ląstelėms, tirdami mitochondrijų reakciją į stresą ir atrinkdami genus, sukeliančius chromosomų praradimą ar padidėjimą, fenotipą, kuris buvo sunku mokytis praeityje.
„Manau, kad šis duomenų rinkinys leis atlikti įvairias analizes, apie kurias mes dar net nepagalvojome, žmonėms, kilusiems iš skirtingų biologijos sričių“, – sako Tomas Normanas, tyrimo bendraautorius.
Skaityti daugiau
Japonai išmetė milžinišką turbiną į vandenyną, kad gautų begalę energijos iš srovės.
Yra būdas pagerinti sintezę: tai begalinės energijos šaltinis
Japonijos astronomai galaktikoje aptiko nežinomą struktūrą