Mokslininkai ištyrė daugiau kaip 1000 koronaviruso erškėčio baltymų mutacijų derinių

SARS-CoV-2 išsivystė, kad įgautų smailių baltymo mutacijų – tos viruso dalies, kuri išsiskiria iš jo.

paviršių ir prilimpa prie ląsteliųinfekcija. Šios koronaviruso dalies mutacijos padidina jo gebėjimą prisijungti prie žmogaus ląstelių arba išvengti antikūnų. Naujajame Niujorko universiteto ir Niujorko universiteto Abu Dabio genomikos ir sistemų biologijos centrų tyrime naudojamas kompiuterinis modeliavimas, siekiant įvertinti smailių baltymų mutacijų biologinę reikšmę. Tikslas – nustatyti viruso versijas, kurios glaudžiau jungiasi prie ACE2 receptorių arba yra atsparesnės antikūnams.

Autoriai: Hin Harkas Ganas ir Christine Gansalus, NYU Biologijos katedra.

Mokslininkai teigia, kad būtent šios smaigo baltymo mutacijos yra pagrindinė greito viruso plitimo kai kuriose pasaulio vietose priežastis.

Pastaraisiais mėnesiais nauja ir dar daugiauužkrečiamos koronaviruso padermės, sukėlusios naujas epidemijos bangas tokiose šalyse kaip Indija ir Brazilija. Blogėjanti situacija reikalauja metodų, leidžiančių greitai numatyti naujas infekcines virusų padermes. Tačiau sekti naujas galimybes nėra lengva užduotis; genomo sekos rodo, kad, pavyzdžiui, vien tik SARS-CoV-2 smaigalyje yra apie 5000 galimų variantų.

Patikrinimas dėl tokių plačių galimybiųkelia didžiulį iššūkį tradiciniams eksperimentiniams metodams, pažymi mokslininkai. Kompiuterinių modelių pranašumas yra tas, kad per kelias dienas galima lengvai įvertinti šimtą mutacijų.

Mokslininkai kreipėsi į skaičiavimo metodąkuri modeliuoja, kaip SARS-CoV-2 smaigalio baltymas atpažįsta ACE2 receptorių – daugelio ląstelių tipų paviršiuje esantį baltymą – kad patektų į ląsteles šeimininkus. Jie įvertino 1 003 koronaviruso smaigalio baltymų mutacijų derinius, įskaitant tuos, kurie sukėlė infekcijų padidėjimas Brazilijoje, Pietų Afrikoje, JK ir Indijoje.

Sistemingas variantų vertinimas parodėSpygliuotos mutacijos, tvirtai susijungiančios su ACE2 receptoriumi, įvyksta dviejuose mutacijų klasteriuose arba „karštose vietose“ jungimosi sąsajoje. Jie yra struktūriškai lanksčiuose regionuose. Tai reiškia, kad mutacijos, didinančios prisijungimą, efektyviai perprogramavo stuburo konformaciją, kad sustiprintų jo gebėjimą atpažinti ACE2 receptorius.

Tyrimas buvo paskelbtas Molekulinės biologijos leidinys.

Taip pat skaitykite

„Skyborg“ autonominis „USF“ skraidymo aparatas atlieka pirmąjį skrydį

Didžiulis kandis rastas Australijoje. Jos sparnų ilgis yra 25 cm

Mokslininkai betoninius namus pavertė baterijomis