Mokslininkai iš Maskvos valstybinio universiteto. Lomonosovas nustatė keletą naujų skaitomumą kontroliuojančių mechanizmų
DNR dviguba spiralė yra kaip varžtas.Daroma prielaida, kad jis vienu metu gali slysti ir slinkti savo apvalkalo baltymų paviršiumi. Mums pavyko parodyti, kad dėl vietinių DNR ir histono baltymų deformacijų šis procesas vyksta etapais. Iš pradžių sukasi vienas DNR gabalas, o paskui kitas – savotiškas vikšras-sraigtinis mechanizmas.
Aleksejus Šaitanas, vienas iš darbo autorių, Maskvos valstybinio universiteto vadovaujantis mokslininkas
Bendras visų žmogaus chromosomų DNR molekulių ilgisyra apie 2 metrus. Mūsų ląstelės suspaudžia DNR grandines 10 tūkstančių kartų, kad tilptų į branduolį. Pavyzdžiui, ląstelė vynioja DNR grandinę aplink specialias molekulines histono baltymų „rites“ Dėl to genomas gali būti supakuotas labai kompaktiškai, tačiau nemaža dalis DNR grandinės yra paslėpta šių struktūrų viduje.
Kaip tiksliai vyksta DNR judesiai nukleosomoje,dar neseniai liko neaiškus. Norėdami tai išspręsti, mokslininkai modeliavo atominio lygio nukleosomų molekulinę dinamiką „Lomonosov-2“ superkompiuteryje per rekordiškai ilgą laiką - 15 mikrosekundžių. Tai yra, superkompiuteris veikė kaip tam tikras skaičiavimo mikroskopas, kuris leido ištirti DNR judėjimo mechanizmus genome.
Dėl to Shaitanas ir jo kolegos atsekėkaip DNR grandinė atsiskiria nuo baltymų, kaip kinta jos struktūra ir kokie veiksniai įtakoja nukleotidų grandinės judėjimą, taip pat jos vėl susijungimą su baltymų spirale.
Tyrimas taip pat svariai prisideda iššifruojant genomo funkcionavimo mechanizmus.
Skaityti daugiau
Buvo sukurtas pirmasis tikslus pasaulio žemėlapis. Kas negerai visiems kitiems?
Išradingumo sraigtasparnis sėkmingai pakyla Marse
NASA pasakojo, kaip jie pristatys Marso pavyzdžius į Žemę