TALEN genomo redagavimo įrankis 5 kartus lenkia CRISPR-Cas9

Trapus X sindromas, pjautuvinė anemija, beta talasemija ir kitos ligos yra

Atlikę tyrimą, mokslininkai padarė išvadą, kad tokiose tankiai supakuotose genomo dalyse įrankisTALEN redagavimas yra efektyvesnis nei tradicinis CRISPR/Cas9.Biologai praneša apie savo išvadasŽurnaleGamtos komunikacijos.

Pasak Humino Zhao, Ilinojaus universiteto Urbana-Champaign chemijos ir biomolekulinės inžinerijos profesoriaus, vadovavusio naujam tyrimui, atradimas patvirtina"Reikalingas platesnis genomo redagavimo įrankių pasirinkimas, kad apimtų visas genomo dalis.

„CRISPR yra labai galingas įrankis, kuris pakeitė genų inžineriją“, - paaiškina Zhao. - Bet jis vis tiek turi tam tikrų apribojimų.

Zhao ir jo kolegos naudojo fluorescencinęvienos molekulės mikroskopija, skirta tiesiogiai stebėti, kaip gyvų žinduolių ląstelėse veikia du genomo redagavimo įrankiai. Fluorescenciniai žymekliai leido tyrėjams išmatuoti, kiek laiko prireikė CRISPR ir TALEN judėjimui palei DNR, taip pat aptikti ir iškirpti tikslinius regionus.

"Mes nustatėme, kad CRISPR geriau veikia mažiau pažeidžiamuose genomo regionuose, tačiau TALEN gali "Prieiga prie šių genų heterochromatino regione yra geresnė nei CRISPR", - sakė Zhao."Taip pat matėme, kad TALEN gali turėti didesnį redagavimo efektyvumą nei CRISPR.Tai gali iškirpti DNR ir tada efektyviau atlikti pakeitimus."

Iš viso TALEN buvo penkis kartusefektyviau nei CRISPR keliuose eksperimentuose. Bet kokiu atveju rezultatai padės patobulinti požiūrį į skirtingas genomo dalis, Zhao daro išvadą: "Arba mes galime naudoti TALEN tam tikroms programoms, arba mes galime pabandyti pagerinti CRISPR veikimą naudojant heterochromatiną".

Skaityti daugiau

Abortas ir mokslas: kas nutiks gimdantiems vaikams

Radarai rado paskutinį Tlingito fortą Aliaskoje. Jie jo ieškojo daugiau nei 100 metų

Trečdalis atsigavusių po COVID-19 grįžta į ligoninę. Kas aštuntas - miršta

Ilinojaus universitetas, Urbana-Champaign, UIUC- didžiausias iš Ilinojaus universiteto miestelių. Įkurta 1867 m. Įsikūręs sujungtuose miestuose Urbana ir Champaign Ilinojaus centre, JAV.

Heterochromatinas - chromatino sritys, kurios ląstelių ciklo metu būna kondensuotos (kompaktiškos) būsenos. Heterochromatinės DNR ypatybė yra itin mažas jos perrašomumas.

Transkripcijos aktyvatoriaus tipo efektorių nukleazės ( TALENs) reiškiayra apribojimo fermentai, kurie gali būti sukurti taip, kad sumažintų specifines DNR sekas.

CRISPR - specialūs bakterijų ir archajų lokusai,susidedantis iš tiesiai besikartojančių sekų, atskirtų unikaliomis sekomis. Tarpikliai yra pasiskolinti iš svetimų genetinių elementų, su kuriais susidūrė ląstelė.

Cas9 (CRISPR susijęs baltymas 9,Su CRISPR susijęs baltymas) yra orientacinė RNR kontroliuojama endonukleazė, susijusi su prisitaikančia imunine sistema CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Palindromic Repeats) daugelyje bakterijų, ypačStreptococcus pyogenes.S. pyogenesnaudoja Cas9 svetimai DNR, pvz., bakteriofago ar plazmidės DNR, saugojimui, apžiūrai ir pjaustymui.