Kāds ir koronavīrusa "britu" celms?
Celms 202012/01 ir SARS-CoV-2 vīrusa celms, kas izraisa COVID-19. Šis
Tas korelē ar ievērojamu Covid-19 infekcijas gadījumu skaita pieaugumu Apvienotajā Karalistē; tiek uzskatīts, ka šis pieaugums vismaz daļēji ir saistīts ar N501Y mutāciju smailes glikoproteīna receptorus saistošajā domēnā, kas saistās ar ACE2 receptoru cilvēka šūnās.
Celms ir ievērojams arī ar lielu skaitu mutāciju, salīdzinot ar zināmo SARS-CoV-2 mutāciju tendenci 2020. gada decembrī.
Celms ir pazīstams ar vairākiem nosaukumiem, uz kuriem parasti atsaucas valdības ziņojumos un plašsaziņas līdzekļos"Britu Covid-19 celms" un "Britu koronavīrusa celms".
Anglijas Sabiedrības veselība šo celmu iepriekš nodēvēja par "pirmo celmu, kas tika pārskatīts 2020. gada decembrī" (VUI – 202012/01), bet Mira Čanda un kolēģi 2020. gada 21. decembrī publicētajā ziņojumā Mira Čanda un kolēģi to pārklasificēja par "bažas celmu".
Konsorcija vārdā rakstītā ziņojumāGenomika COVID-19 UK (COG-UK) Endrjū Rambo un viņa līdzautori šo celmu minēja kā ciltslīniju B.1.1.7. CDC šo celmu sauc arī par 20B / 501Y.V1.
Valstis, kurās ir apstiprināti GOS-2020/12/01 gadījumi
No kurienes viņš nāca?
Acīmredzot no Dienvidāfrikas.Pirmo ziņojumu par šo celmu da Oliveiras vadīta vietējo biologu grupa publicēja 2020. gada 22. decembrī - paraugi tika savākti oktobra sākumā. Tā kā ne visās valstīs ir jaunu celmu uzraudzības programmas, pati pirmā noteikšana valstī, protams, nepierāda, ka variants radies tieši tajā vietā, kur tas atrasts.
"Britu" celma īpašības
- Ģenētika
SARS-CoV-2 vīrusa mutācijas notiek diezgan biežiBieži: saskaņā ar Lielbritānijas COVID-19 Genomics Consortium (COG-UK) datiem, tikai smailejā glikoproteīnā dažādos šī vīrusa celmos ir konstatētas vairāk nekā 4000 mutācijas.
VOC-202012/01 celmu nosaka 23 mutācijas: 13 nesinonīmas mutācijas, 4 delēcijas un 6 sinonīmiskas mutācijas (t.i., 17 mutācijas maina olbaltumvielas un 6 nemaina).
- Pārnesamība
2020. gada 18. decembrī Lielbritānijas zinātniskā padomdevēja struktūra NERVTAG (Padomdevēja grupa jauno un jauno elpceļu vīrusu jautājumos) secināja, ka tām ir mērena pārliecība, ka VUI-202012/01 ir ievērojami lipīgāks nekā citi celmi, un vēl nav pietiekamu datu, lai izdarītu galīgus secinājumus par paaugstinātas pārnesamības mehānismu.
NERVTAG iegūtie dati parādīja, ka šim celmam ir "koeficients"Vēlākajos darbos kā mērs tika izmantots relatīvais reprodukciju skaits, kas ir atlases koeficienta rādītājs.
Pamatojoties uz nedaudz atšķirīgiem datiem, tika noteikts, ka relatīvais reprodukciju skaits ("multiplikatīvā priekšrocība") ir 1,74 (tas nozīmē, ka celms ir par 74% lipīgāks).
Šis celms kļuva dominējošs Londonā, kā arī Anglijas austrumos un dienvidaustrumos viena līdz divu mēnešu laikā.Līdzīgs straujš pieaugums ir novērots Īrijā, un izskatās, ka šis celms drīz kļūsdominē arī tur.
Paredzams, ka to darīs arī ASVmartā. SARS-CoV-2 infekciju pieaugums jaunā gada sākumā tiek uzskatīts par celma palielinātas pārnesamības rezultātu, savukārt citu celmu sastopamība samazinās. Tam nepieciešamas stingrākas robežas, lai izvairītos no straujas eksponenciālas infekciju palielināšanās. Savukārt šī celma pārraides kontrole izskatās arvien vājāka.
Pirmais britu vīrusa celma attēls
Vai vakcīnas ir efektīvas pret to?
Iepriekš ir izstrādātas vairākas vakcīnas COVID-19.
Tomēr, tā kā rodas vairāk mutāciju, var būt nepieciešams mainīt vakcīnu.SARS-CoV-2 mutē tik ātri kā, piemēram, gripas vīrusi, un jaunas vakcīnas, kas izrādījušās efektīvas līdz 2020. gada beigām, irveidus, kurus pēc vajadzības var mainīt.
No 2020. gada beigām struktūrasveselības eksperti un eksperti no Vācijas, Lielbritānijas un Amerikas uzskata, ka esošās vakcīnas būs tikpat efektīvas pret GOS-202012/01 celmu kā pret iepriekšējiem celmiem.
2020. gada 18. decembrī NERVTAG secināja, ka "pašlaik nav pietiekamu datu, lai izdarītu secinājumus par šī celma nejutīgumu pret vakcīnas antigēniem".
Līdz šim valsts veselības dienestsLielbritānija ir apstiprinājusi, ka "nav pierādījumu" tam, ka jaunais celms būs izturīgs pret Pfizer-BioNTech vakcīnu, kas pašlaik tiek izmantota Lielbritānijas vakcinācijas programmā, tāpēc vakcinētie cilvēki joprojām ir aizsargāti.
Kas ir īpašs “britu” celmā?
Kopumā "britu" celmam ir 29 mutācijassalīdzinot ar sākotnējo Wuhan celmu. Tas liek domāt, ka tas mutē daudz ātrāk nekā pēdējais, kam virusologi ir reģistrējuši aptuveni divas mutācijas mēnesī.
Turklāt daudzas mutācijas atrodamas olbaltumvielāsērces ērces, veicina vīrusa saistīšanos ar saimniekšūnu receptoriem. Tāpēc zinātnieki liek domāt, ka B.1.1.7 celms būs bīstamāks - tam būs lielāka virulence un, iespējams, spēja izvairīties no izstrādāto vakcīnu iedarbības.
Jaunā pētījumā autori nolēma izmantotdatorsimulācijas, lai prognozētu, kā dažādas "britu" celma mutācijas ietekmēs infekcijas izplatības ātrumu un smagumu, kā arī paša vīrusa replikāciju un patoģenēzi.
Lai izskaidrotu neparasti augsto mutāciju biežumu gan S smaile proteīnā, gan N termināla domēnā, pētnieki piedāvā trīs paskaidrojumus:
- ilgstoša inficēšanās ar vīrusu pacientam ar novājinātu imūnsistēmu ļāva vīrusam ātri mutēties;
- adaptīvās mutācijas sākās dzīvnieku saimniekiem, tika pārnestas uz cilvēkiem ar zoonozes transmisiju un turpinājās cilvēka saimniekorganismā;
- selektīva atlase, kas notiek vīrusa struktūrā zem antivielu spiediena.
Simulācijas rezultāti to parādījaūdeņraža saišu stabilitāte mutantu variantā ir augstāka. Tā smaile proteīns arī veido vairāk saišu ar saimniekšūnu receptoru, un šīs saites saglabājas ilgāku laiku. Aprēķinātais B.1.1.7 celma pārraides ātrums ir par 70% lielāks, un reprodukciju skaits ir par 0,4 lielāks nekā klasiskā varianta.
Briesmas, pēc autoru domām, arī slēpjaska, pārbaudot standartus, reversās transkripcijas polimerāzes ķēdes reakcija jeb RT-PCR var neatpazīt jaunā celma vīrusa RNS. Turklāt mutācijas izmainīts celms var ļaut tam izvairīties no antivielu neitralizācijas un samazināt vakcīnu efektivitāti.
Kur tas tiek izplatīts?
Tagad - praktiski visā pasaulē.Saskaņā ar lielāko genomu datu bāzi GISAID lielākā daļa atbilstošo paraugu tika atrasti Lielbritānijā, Dānijā, ASV, Francijā, Spānijā un Īrijā, ir genomi pat no tādām salīdzinoši plaukstošām valstīm kā Jaunzēlande un Singapūra. Izplatīšanas kartes var apskatīt šeit.
Ar celma klātbūtni Krievijā situācija nav pilnībāskaidrs. 10. janvārī Anna Popova ziņoja par tā atklājumu valstī. Tomēr lielākajā atvērtajā starptautiskajā datubāzē B.1.1.7 varianta genomu GISAID. no Krievijas nr.
Lasīt vairāk
Paskaties 8 triljonu pikseļu Marsa attēlu
Zinātnieki ir izstrādājuši relativitātes teorijas aizstājēju. Kāda ir "visa teorijas" būtība?
Aborts un zinātne: kas notiks ar bērniem, kas dzemdēs