Ir izstrādāta jauna metode SARS-CoV-2 alfa varianta noteikšanai notekūdeņos

Zinātnieki no starpdisciplinārās pētniecības grupas par antimikrobiālo rezistenci (AMR) in

Singapūras atrašanās vieta ar darbiniekiem no BiobotAnalytics, Nanjangas Tehnoloģiskā universitāte (NTU) un MIT ir veiksmīgi izstrādājuši novatorisku metodi SARS-CoV-2 B.1.1.7 (Alfa) varianta molekulārai meklēšanai.  Tas ļaus notekūdeņos ātri un lēti uzraudzīt citus jaunā tipa koronavīrusa variantus.

Notekūdeņu monitorings palīdz ātri unneuzkrītoši izsekojot COVID-19 izplatībai. Papildu informācija ļauj veselības iestādēm izsekot pandēmijai kopienas līmenī. Pavisam nesen Singapūras dzīvojamajos rajonos tika atklāti SARS-CoV-2 vīrusa fragmenti kā daļa no proaktīvas notekūdeņu novērošanas programmas. Šī informācija kopā ar papildu pārbaudēm ļāva valsts Veselības ministrijai ātri reaģēt uz situāciju.

Tomēr koronavīrusa variantu noteikšana arnotekūdeņu monitorings ir retāk sastopams esošo tehnoloģiju problēmu dēļ. Nākamās paaudzes secība notekūdeņu monitoringam ir laikietilpīga un dārga. Testos trūkst arī jutīguma. Starptautiska zinātnieku komanda jaunā pētījumā centās risināt šo problēmu.

Pētījumā, kas publicētsžurnāls Vides zinātne & Technology Letters, zinātnieki izskaidro novatorisku molekulārās noteikšanas metodi, kuras pamatā ir alēlei specifisks RT-qPCR, kas nosaka un kvantitatīvi nosaka B.1.1.7 (Alfa) variantu. Izstrādātais tests, kas pārbaudīts un apstiprināts ar notekūdeņu paraugiem no 19 ASV kopienām, spēj ticami noteikt un kvantitatīvi noteikt B.1.1.7 (Alfa) varianta zemus līmeņus ar zemu krustenisko reaktivitāti un variantu proporcijām līdz 1 procentam jauktā veidā. SARS vīrusa fons. -CoV-2.

Metodi, kuras mērķis ir proteīnu tapas mutācijas, kas paredz B.1.1.7 variantu (alfa), var īstenot, izmantojot komerciāli pieejamus RT-qPCR protokolus.

Lasīt vairāk

Zemes rotācijas palēnināšanās izraisīja skābekļa izdalīšanos uz planētas

Astronomi dziļā kosmosā atklāj neparastas struktūras

Skatiet vairāk 60 000 gadu veco neandertāliešu klinšu mākslu

AMR - pretmikrobu rezistence

RT -qPCR - kvantitatīva PCR reversā transkripcija.