AI palīdz atpazīt seno vīrusu RNS atliekas cilvēka genomā

Iepriekšējie pētījumi liecina, ka vīrusam nonākot cilvēka (un citu dzīvnieku) organismā, tas

 var mainīt saimniekdatora DNS, pievienojot daļusava RNS. Ir arī zināms, ka senie vīrusi, kas inficēja iedzīvotājus pirms daudziem gadiem, dažkārt atstāja savas RNS paliekas cilvēka genomā. Tomēr to atrašana izrādījās grūts uzdevums, jo katram “aizdomās turētajam” vīrusam bija nepieciešams daudz salīdzinājumu. Jaunajā darbā pētnieki izmantoja mašīnmācīšanās algoritmu, lai atrisinātu problēmu.

Lai apmācītu algoritmu, zinātnieki izmantoja RNS nozināmi neretrovīrusu endogēno RNS vīrusu elementi. Apmācot mūsdienu vīrusu RNS algoritmu, sistēma varētu sajust, kā tas izskatās kopumā. Pētnieki uzskata, ka šāda līdzība, iespējams, pastāvēja arī senajā RNS. Pēc apmācības zinātnieki pārveidoja sistēmu, lai novērstu pēc iespējas vairāk viltus pozitīvu rezultātu. Pēc tam viņi to vadīja uz cilvēka genomu un atrada apmēram 100 iespējas tālākai izskatīšanai. Pārbaudot tos, pētnieki atklāja, ka daudzi no viņiem jau bija zināmi, un daži bija zem sliekšņa, ko viņi noteica kā izturēšanas / neizdošanās iespēju. Viņiem ir palicis tikai viens iespējamais nezināma vīrusa atlikums.

Vēlāk zinātnieki pārbaudīja, vai viņi to ir atradušiatlikušais vīrusa RNS citu sugu, piemēram, pērtiķu un šimpanžu, genomos. Šis atklājums liecina, ka infekcija un turpmākas DNS izmaiņas notika vismaz pirms 43 miljoniem gadu.

Pētnieki atzīmēja, ka plašāka informācija par senajiem vīrusiem un to ietekmi uz cilvēka genomu sniegs ieskatu mūsdienu vīrusu uzvedības niansēs, kuras joprojām nav zināmas.

Lasīt vairāk

Aborts un zinātne: kas notiks ar bērniem, kas dzemdēs

Radari ir atraduši pēdējo Tlingitas fortu Aļaskā. Viņi viņu meklēja vairāk nekā 100 gadus

Trešdaļa no tiem, kuri ir atveseļojušies pēc COVID-19, atgriežas slimnīcā. Katru astoto - nomirst