Līdz šim jaunais koronavīrusa veids visā pasaulē ir izraisījis 3,9 miljonus nāves gadījumu. Pandēmijas sākumā
Tagad Sietlas pētnieks ir atklājis izdzēstus failus no Google Cloud, kas atklāj 13 daļējas ģenētiskās sekvences no dažiem agrākajiem COVID-19 gadījumiem Vuhanā.
Secības neizjauc līdzsvaruno vai no daudzām teorijām par SARS-CoV-2 rašanos. Piemēram, viņi neatbalsta teoriju, ka vīruss noplūda no augstas drošības laboratorijas Uhaņā. Tomēr pierādījumi liecina, ka jaunais koronavīruss izplatījās pat pirms pirmā lielā uzliesmojuma tika atklāts jūras velšu tirgū Ķīnas provinces teritorijā.
Lai precīzi noteiktu, kā un kur notikavīruss, zinātniekiem jāatrod tā sauktais prekursoru vīruss, no kura cēlušies visi pārējie celmi. Līdz šim agrākās sekvences pārsvarā ņemtas no gadījumiem Huananas jūras velšu tirgū Vuhanā. Sākotnēji tika domāts, ka SARS-CoV-2 pirmo reizi parādījās 2019. gada decembra beigās. Tomēr gadījumiem no tā gada decembra sākuma līdz novembrim nebija nekādas tirgus saiknes. Tas norāda, ka vīruss cēlies no citas vietas.
Tirgū atrastie gadījumi ietver trīsmutācijas, kuru nav vīrusu paraugos, kas atklātas nedēļas vēlāk ārpus tirgus. Vīrusi bez mutācijām precīzāk atbilda koronavīrusiem, kas atrasti pakavu sikspārņiem. Zinātnieki ir pārliecināti, ka jaunais koronavīruss kaut kā ir cēlies no sikspārņiem, tāpēc ir loģiski pieņemt, ka arī ciltsvīram nebija šo mutāciju.
Un tagad Džesijs Blūms no Medicīnas institūtaHovards Hjūzs Sietlā atklāja, ka izdzēstajos secības datos (iespējams, daži no agrākajiem vīrusa paraugiem) arī nebija šo mutāciju.
Apmēram pirms gada 241 ģenētiskaissecība no koronavīrusa pacientiem ir pazudusi no Nacionālo veselības institūtu (NIH) uzturētās tiešsaistes datu bāzes Sequence Read Archive.
Blūms pamanīja trūkstošās sekvences,kad 2020. gada maijā PeerJ publicētajā pētījumā uzdūros izklājlapai. Viņi bija daļa no Uhaņas universitātes projekta PRJNA612766 un, iespējams, tika augšupielādēti arhīvā. Zinātnieks arhīva datubāzē meklēja secības un saņēma ziņojumu "Vienumi nav atrasti".
Viņa izmeklēšana atklāja, ka svītrotssecības apkopo Uhaņas Universitātes slimnīca. Tajā pašā laikā pētījuma priekšdruka, kas publicēta, pamatojoties uz šīm secībām, liecina, ka epidēmijas sākumā tie tika ņemti no deguna tamponu paraugiem ambulatoriem pacientiem ar aizdomām par COVID-19.
Blūms nespēja atrast izskaidrojumu, kāpēc secības tika noņemtas un uz viņa e-pastiem pētījuma autoriem netika atbildēts.
Zinātnieks atzīmē, ka "nav pārliecinoša zinātniskadatu dzēšanas iemesli." Lieta tāda, ka secības pilnībā atbilst darbā aprakstītajiem paraugiem. Dokumentā labojumu nav. Turklāt pētījumā uzsvērts, ka paraugi tika iegūti brīvprātīgi no indivīdiem, un sekvencēšana neliecina par plazmīdu vai paraugu piesārņojumu. "Šķiet, ka secības tika noņemtas, lai slēptu to esamību," secina Blūms.
Raksts ar viņa atklājumiem tika publicēts biorxiv preprint tīmekļa vietnē.
Lasīt vairāk
Vēsturē lielākā komēta ir redzama Saules sistēmā: tā ir gandrīz planēta
Jauna metode oglekli uzreiz pārvērš grafēnā vai dimantos
Atrasts lēts veids, kā ietaupīt megapilsētu centrus no pārkaršanas