Kā parādās celmi
Vīrusi vairojas tikai dzīvā šūnā, izmantojot tās resursus.
Pasaulē nav vispārpieņemtas nomenklatūrascelmu nosaukumi un izmantotie nosaukumi ir diezgan patvaļīgi. Parasti tie sastāv no atsevišķiem burtiem un cipariem, kas tiek rakstīti pēc sugas nosaukuma. Piemēram, viens no slavenākajiem E. coli celmiem irE. coliK−12.
Vīruss mēģina novērst replikācijas neveiksmes, bet ne vienmēr veiksmīgi. Ja mutācija patogēnam dod dzīvības priekšrocības, tā var noturēties.
Baktēriju celma kolonijasJersīnijauz agara-agara virsmas
Šobrīd ir zināms, ka SARS-CoV-2uzkrāj mutācijas apmēram tādā pašā ātrumā kā gripas izraisītājs. Mutācijas jauna veida koronavīrusa genomā gandrīz vienmēr rodas nevis nejaušu kļūdu dēļ kopēšanas laikā, piemēram, daudzos citos vīrusos, bet gan bojātu vai nepareizi rediģētu jau pabeigtu vīrusa RNS kopiju rezultātā.
Kā tiek atrasti jauni COVID-19 celmi
Gļotādu paraugi tiek ņemti no pacientiem unatšifrēt patogēna genomu. Šī informācija tiek ielādēta kopējās datu bāzēs un salīdzināta. Piemēram, GISAID datubāzē ir vairāk nekā divi miljoni koronavīrusa genomu no visas pasaules. Ir izsekotājs, kas vizualizē, kura opcija kādā valstī tika identificēta.
Līdz 16. janvārim Rospotrebnadzor ziņoja, ka tā ir nākusi klajā ar īpašu testu, kas identificētu britu celmu. Viņš parādīs rezultātu 1,5 stundas pēc tam, kad persona paņēma uztriepi.
Ir nepieciešami padziļinātāki un sarežģītāki testilai pateiktu, kāda slodze ir pacientam. Tagad [izmantojot PCR testus] var noskaidrot, vai cilvēkam ir aktīvs vīruss – vai ir kāds Covid-19 variants vai nav. Bet tas nenozīmē, ka nav iespējams noteikt konkrētu celmu, tas vienkārši prasa vairāk laika un naudas.
Aleksejs Agranovskis, Maskavas Valsts universitātes profesors un bioloģijas zinātņu doktors
Tāpēc Krievijā uzziniet, cik cilvēkusaslimis ar koronavīrusu ar noteiktu mutāciju, tas vēl nav iespējams, bet to var izdarīt izlases veida testi, lai saprastu, cik plaši izplatīts ir konkrēts X celms.
CoVariants vietnē, izmantojot GISAID datus, varat redzēt, kuras mutācijas atšķir konkrētā varianta genomu. Tādējādi delta variantam ir četras nozīmīgas tapas proteīna mutācijas un divas dzēšanas.
Bīstamākie COVID-19 varianti
PVO ir klasificējusi četrus variantus kā bīstamus: alfa, beta, gamma un delta.
- Alfa
Celms pirmo reizi tika atklāts 2020. gada oktobrī COVID-19 pandēmijas laikā Apvienotajā Karalistē no iepriekšējā mēnesī savāktā parauga.
Kopš tā laika viņa izredzes dominēt ir dubultojušāsik pēc 6,5 dienām (pieņemtais paaudzes intervāls). Tas ir saistīts ar ievērojamu COVID-19 infekciju pieaugumu Apvienotajā Karalistē.
Ir daži pierādījumi, ka šim variantam ir par 30% līdz 70% paaugstināta transmisija, un sākotnējie pētījumi liecina, ka ir palielināta letalitāte.
Tomēr, tā kā rodas vairāk mutāciju, var būt nepieciešams mainīt vakcīnu.SARS-CoV-2 mutē tik ātri kā, piemēram, gripas vīrusi, un jaunas vakcīnas, kas izrādījušās efektīvas līdz 2020. gada beigām, irveidus, kurus pēc vajadzības var mainīt.
No 2020. gada beigām struktūrasveselības eksperti un eksperti no Vācijas, Lielbritānijas un Amerikas uzskata, ka esošās vakcīnas būs tikpat efektīvas pret GOS-202012/01 celmu kā pret iepriekšējiem celmiem.
- Beta
Kā ziņots, celms pirmo reizi tika atklāts Dienvidāfrikā2020. gada 18. decembrī ziņoja Dienvidāfrikas Veselības departaments. Pētnieki un amatpersonas teica, ka šī celma izplatība ir lielāka jauniešu vidū bez jebkādiem pamata veselības traucējumiem, un, salīdzinot ar citiem celmiem, tas, visticamāk, izraisīs nopietnas slimības šajos gadījumos.
Zinātnieki atzīmēja, ka šajā celmā ir vairākas mutācijas, kas ļauj vieglāk piesaistīties cilvēka šūnām.
2021. gada 8. janvārī Guardian paziņoja, ka vakcīnaPfizer un COVID-19 BioNTech testos, ieskaitot 20 asins analīzes, ir pierādījuši, ka tas spēj nodrošināt aizsardzību pret 501.V2 celmu. Ir nepieciešami turpmāki pētījumi, lai noteiktu precīzu aizsardzības pakāpi.
2021. gada 24. februārī uzņēmums Moderna paziņoja par savas vakcīnas jaunās versijas klīnisko pētījumu sākšanu. Jaunā versija ir īpaši izstrādāta darbam ar 501.V2.
- Gamma
Celms pirmo reizi tika atklāts Tokijā 2021. gada 6. janvārīgadu veica Nacionālais infekcijas slimību institūts (NIID). Jaunais celms tika atklāts četriem cilvēkiem, kuri ieradās Tokijā no Amazonas štata 2021. gada 2. janvārī.
Jaunais celms pirmo reizi parādījās jūlijā un bija pirmaistika atklāts oktobrī, bet publicēšanas laikā (2020. gada decembris), lai gan tā biežums ievērojami pieauga, izplatīšana joprojām galvenokārt aprobežojās ar Riodežaneiro štata galvaspilsētu.
Jaunums bija tapas proteīna K417T mutācija, kas ļaujvīruss ciešāk saistās ar cilvēka šūnām, un dažos gadījumos pat izvairās no antivielām. Turklāt vīruss spēcīgāk nekā sākotnēji inficē jauniešus un grūtnieces.
2021. gada 11. februārī Brazīlijas Veselības ministrijas vadītājs Eduardo Pazuello paziņoja, ka šis celms ir trīs reizes infekciozāks nekā "oriģinālais" SARS-CoV-2.
- Delta
2020. gada oktobrī līnija B.1.617.2 pirmo reizi tika konstatēta Indijā. 2021. gada aprīļa otrajā pusē Krievijā ienāca Indijas delta celms.
2021. gada 14. jūnijā tas tika atklāts Indijāmutācijas variants B.1.617.2, kas ir pazīstams kā AY.1 jeb “delta plus” variants. “Delta Plus” izceļas ar mutācijas K417N klātbūtni smailes proteīnā, kas var samazināt antivielu aktivitāti atveseļotiem un vakcinētiem cilvēkiem.
Indijas Veselības ministrija nosauca trīs atšķirīgas iezīmes"delta plus": palielināta lipīgums, uzlabota spēja saistīties ar plaušu šūnu receptoriem un iespējama rezistence pret monoklonālo antivielu terapiju.
Līdz 2021. gada jūlija sākumam Pasaules organizācijaVeselības aprūpē delta celms ir reģistrēts 98 valstīs ar augstu un zemu iedzīvotāju vakcinācijas līmeni, un daudzās valstīs tas kļūst dominējošs.
Saskaņā ar Krievijas konsorciju parSekvencējot SARS-CoV-2 (Coronavirus Russian Genetic Initiative, CoRGI) genomus, delta celms 2021. gada maijā Sanktpēterburgā iegūtajos paraugos aizņēma nedaudz vairāk nekā pusi (52%), bet 2021. gada jūnijā-vairāk nekā 90%.
Tāpat "delta plus", kas pagājušā gada jūnijā tika identificēts Nepālā, pieder draudu kategorijai. Spike proteīnā ir piecas mutācijas, kas padara vīrusu ļoti bīstamu.
Kādas iespējas meklē COVID-19 zinātnieki
PVO sarakstā ir vēl četri SARS-CoV-2 varianti, kas interesē, taču līdz šim nav pamata uzskatīt tos par bīstamākiem: Eta, Iota, Kappa, Lambda.
- Lambda
Tā sauktais "lambda celms" SARS-CoV-2 pirmo reizipagājušās vasaras beigās piešķīra Peru. Par jaunā celma infekcijām ziņots arī Argentīnā un Čīlē. Pēc tam tas izplatījās Vācijā, Spānijā, ASV, Lielbritānijā un vairākās citās valstīs.
"Lambda celma" genomā ir astoņu komplektsgalvenās mutācijas, kas, domājams, palielina vīrusa infekciozitāti. Brazīlijas zinātnieki, kurus vadīja Priscila Wink no Rio Grande do Sul federālās universitātes, vispirms Brazīlijā reģistrēja SARS-CoV-2 "lambda varianta" pēdas un atklāja jaunu šīs vīrusa versijas variantu. Celma "lambda" tika konstatēta 19. jūlijā 29 valstīs
- Iota
Celms tika identificēts pagājušā gada martā Ņujorkā,tas izplatījās par 35% ātrāk. Kādu laiku veiksmīgi konkurējot ar alfa, zinātnieki pieņēma, ka kombinācijā ar smailes proteīna E484K mutāciju, kas palīdz izvairīties no antivielām, šī iespēja būtu bīstama. PVO viņam piešķīrusi draudošu statusu. Bet šīs prognozes nepiepildījās, un tagad viņš vienkārši tiek novērots.
Vai vakcīnas palīdzēs pret jauniem celmiem?
Skaidras atbildes nav. Vakcīnu efektivitāti var novērtēt dažādos veidos:
- Uzraugiet, kā mainās jauno lietu skaitsinfekcijas un hospitalizācija. Piemēram, Lielbritānijā gandrīz 88% pieaugušo iedzīvotāju ir saņēmuši vienu vakcīnas devu, 67% - otro. Valstī dominē delta variants. Saskaņā ar oficiālo statistiku pēdējās nedēļas laikā saslimstības rādītājs pieaudzis par vairāk nekā trešdaļu, bet hospitalizēto skaits pieaudzis par 46,8%.
- Laboratorijā veiciet eksperimentu. Zinātnieki izveido pseidovīrusu ar smailes proteīnu, pievieno tā genomam vienu mutāciju pēc otras, imitējot pētāmo variantu. Pēc tam to sajauc ar pilnībā vakcinētu cilvēku asins serumu un pilina uz cilvēka šūnu līniju, kas ir uzņēmīga pret koronavīrusu. Pēc dažām dienām inficētās šūnas tiek skaitītas.
Lasīt vairāk:
Paskaidroja, kā Visums atspoguļojas melno caurumu tuvumā
Masveida saindēšanās un jaunas civilizācijas nāves versijas: kā mainījās mūsu zināšanas par maijiem
AAE testē mākslīgo nokrišņu tehnoloģiju 50 grādu karstumā