Komandas izstrādāto rīku sauc par CShaper.
Tas ir spēcīgs skaitļošanas rīks, kas var
Sistemātiski segmentējiet un analizējiet šūnu attēlus konkrētu pārstāvju līmenī.Tas ir ļoti svarīgi šūnu dalīšanās izpētei, kā arī šūnu un gēnu funkcijām.Darba teksts
Lai izveidotu skaitļošanas ierīci, biologi pētīja, kā dzīvnieki augno vienas šūnas, apaugļotas olšūnas vai caur neskaitāmām šūnu dalīšanām.Jo īpaši viņi vēlējās uzzināt noteiktas gēnu funkcijas, piemēram, kuri gēni ir iesaistītišūnu sadalījumā dažādu orgānu veidošanā vai kas izraisapatoloģiskas šūnu dalīšanās, kas izraisa audzēju augšanu.
Lai to izdarītu, pētnieki vispirms ieguva šūnu attēlus - to "ģimenes koku".Pēc tam viņi "izslēdz" (izdzēš) gēnu no DNS sekvences un salīdzinaDivi ciltskoki, lai analizētu izmaiņas šūnās un secinātu gēnu funkcijas.Pēc tam eksperiments tiek atkārtots, bet ar dažādiem gēniem.
Biologi pētījumā izmantoja embrijusCaenorhabditis elegans ir tārpu veids, kam ir daudz bioloģisku īpašību ar cilvēkiem, tāpēc to var izmantot, lai pētītu audzēja augšanu cilvēkiem.
"Ņemot vērā, ka C. elegans ir aptuveni 20 000 gēnu, tas nozīmē, ka būtu nepieciešami gandrīz 20 000 eksperimentu, ja vienlaikus izvēlētos vienu gēnu.Tāpēc ir ārkārtīgi svarīgi izmantot mūsu izstrādāto automatizēto attēlu analīzes sistēmu." Izmeklēšanu.
Šūnu attēlus parasti iegūst, izmantojotskenēšana ar lāzera staru. Esošās attēlu analīzes sistēmas var veiksmīgi noteikt tikai šūnas kodolu, tomēr šūnas membrānas attēls būs sliktas kvalitātes, kas apgrūtina šūnas formas rekonstrukciju.
Turklāt nav uzticama algoritma, lai segmentētu šūnu dalīšanas trīsdimensiju attēlus (t.i., četrdimensiju attēlus) pa kadriem.Attēlu segmentācija ir svarīgs process datorredzē, kas ietverSadaliet vizuālo ievadi segmentos, lai vienkāršotu attēlu analīzi.Bet pētniekiem ir jāpavada simtiem stundu, manuāli marķējot daudzus šūnu attēlus.
CShaper jaunā attīstība var noteikt šūnu membrānas, izveidot šūnu formas trīsdimensiju telpā un, vēl svarīgāk, automātiski segmentēt šūnu attēlus šūnu līmenī.
Lasīt vairāk
Bīstama klimata sasilšana sāksies pēc 7 gadiem
Aborts un zinātne: kas notiks ar bērniem, kas dzemdēs
Apskatiet skaistākos Habla attēlus. Ko teleskops ir redzējis 30 gadu laikā?