Autori izstrādāja mini antivielas, izmantojot programmatūru, kas paredz, kā
Šīs ir ļoti pārsteidzošas lietas! Tas paver daudzas iespējas.
Stīvens Mejo, Caltech ķīmiķis
Antivielas labi saistās ar olbaltumvielām, piem.ar dažādiem mikrobiem. Tāpēc farmācijas uzņēmumi tos izmanto kā zāles, lai cīnītos pret infekcijām un vēzi. Bet antivielas ir lielas olbaltumvielas, tāpēc to ražošana ir dārga, un process bieži ir nestabils. Pētījuma autori strādāja, lai pārvarētu šīs problēmas.
Process, kurā antivielas saistās ar mērķiizskatās pēc klinšu kāpēja, kurš mēģina uzkāpt milzīgajā klints, skaidro Deivids Beikers, Vašingtonas Universitātes (UW) skaitļošanas strukturālais biologs. Šādas klints virsma parasti ir gluda, un tajā ir mazs atbalsts rokām un kājām. Antivielas ir lielas, tāpēc tās var satvert daudzus satvērienus vienlaikus un stingri turēties.
Bet mini-antivielām ir mazāk iespēju.Pētnieki mēģināja pārvarēt šo trūkumu; viņi identificēja proteīnu uztveršanas vietas un, pamatojoties uz to, izveidoja mini antivielas. Bet tas darbojas tikai labi izpētītiem proteīniem.
Lai apietu šo problēmu, Beikers un kolēģivērsās pie Rosetta programmatūras, kuru viņi izstrādāja, lai prognozētu olbaltumvielu struktūras, pamatojoties uz to aminoskābju secību. Lai izveidotu potenciālo balstu karti, komanda uzdeva programmai aprēķināt, cik stingri noteiktas aminoskābes saistās ar dažādiem mērķa proteīna virsmas punktiem. Pētnieki izmantoja Rosetta, lai izveidotu desmitiem tūkstošu virtuālu mini antivielu.
Šī programmatūra ļauspētnieki, lai izstrādātu diagnostikas zondes, kas palīdzētu atklāt slimības agrīnā stadijā, piebilst Tanya Kortemme, Kalifornijas Universitātes Sanfrancisko bioinženiere.
Mēs varam izstrādāt proteīnus, laisazinieties ar jebkuru mērķi. Tas nozīmē, ka miniproteīni var ne tikai bloķēt slimību izraisošos proteīnus, bet arī novirzīt zāles uz vēža audiem vai piegādāt gaismu izstarojošas vai radioaktīvas diagnostikas molekulas jebkurām šūnām. Tas palīdzēs izsekot ārstēšanas progresam.
Longxin Cao, UW postdoc
Lasīt vairāk:
“Piektais elements” pastāv: jauns eksperiments apstiprinās, ka informācija ir būtiska
"Džeimss Vebs" uzņēma visspilgtāko zvaigznes fotoattēlu vēsturē
Kvantu uzlāde ļaus rekordlielā ātrumā uzlādēt elektriskos transportlīdzekļus