Projektā tiek izmantota Perturb-seq pieeja, kas ļauj izsekot ieslēgšanas vai izslēgšanas ietekmei
Strādājot ar Perturb-seq tehnoloģijupētnieki veic ģenētiskas izmaiņas šūnās, izmantojot CRISPR-Cas9, un pēc tam izmanto vienas šūnas RNS sekvencēšanu, lai apkopotu informāciju par RNS, kas tiek izteikta šo ģenētisko izmaiņu rezultātā. Pētnieki atzīmē, ka RNS kontrolē katru šūnu uzvedības aspektu, tāpēc šī metode palīdz atšifrēt lielāko daļu minimālo ģenētisko izmaiņu šūnu ietekmes.
Jaunā pētījumā zinātnieki izmantojacilvēka asins vēža šūnu līnijas, kā arī no tīklenes iegūtas nevēža šūnas, lai veiktu Perturb-seq vairāk nekā 2,5 miljoniem šūnu. Pamatojoties uz iegūtajiem datiem, ģenētiķi izveidoja visaptverošu karti, kas saistīja genotipus ar fenotipiem.
Autori uzskata, ka projekta rezultāti palīdzēsnākotnes pētījumi. Piemēram, integrētās kartes veidotāji paši izmantoja datus, lai pētītu nezināmu funkciju gēnu ietekmi uz šūnām, pētītu mitohondriju reakciju uz stresu un pārbaudītu gēnus, kas izraisa hromosomu zudumu vai pieaugumu, kas ir fenotips, kas ir bijis pagātnē grūti mācīties.
"Es domāju, ka šī datu kopa ļaus cilvēkiem, kas nāk no dažādām bioloģijas jomām, veikt visa veida analīzes, par kurām mēs vēl neesam pat domājuši," saka pētījuma līdzautors Toms Normans.
Lasīt vairāk
Japāņi iemeta okeānā milzu turbīnu, lai no straumes iegūtu bezgalīgu enerģiju.
Ir veids, kā uzlabot kodolsintēzi: tas ir bezgalīgas enerģijas avots
Japānas astronomi galaktikā ir atraduši nezināmu struktūru