Zinātnieki ir pētījuši vairāk nekā 1000 koronavīrusa ērkšķu olbaltumvielu mutāciju kombinācijas

SARS-CoV-2 ir attīstījies, iegūstot mutācijas smailes proteīnā, vīrusa daļā, kas izceļas no tā.

virsmām un pieķeras šūnām parinfekcija. Mutācijas šajā koronavīrusa daļā palielina tā spēju saistīties ar cilvēka šūnām vai izvairīties no antivielām. Jauns pētījums no Genomikas un Sistēmbioloģijas centriem Ņujorkas Universitātē un Ņujorkas Universitātē Abū Dabī izmanto datormodelēšanu, lai novērtētu smaiļu proteīnu mutāciju bioloģisko nozīmi. Mērķis ir identificēt vīrusa versijas, kas ciešāk saistās ar ACE2 receptoru vai ir izturīgākas pret antivielām.

Kredīts: Hin Hark Gan un Christine Gansalus, NYU Bioloģijas katedra.

Zinātnieki norāda, ka tieši šīs mutācijas proteīna mutācijās ir galvenais iemesls straujai vīrusa izplatībai dažās pasaules daļās.

Pēdējos mēnešos jauns un vairākinfekcijas koronavīrusa celmiem, izraisot jaunus epidēmijas viļņus tādās valstīs kā Indija un Brazīlija. Situācijas pasliktināšanās prasa metodes jaunu infekcijas vīrusu celmu ātrai prognozēšanai. Taču jaunu iespēju izsekošana nav viegls uzdevums; genoma sekvencēšana rāda, ka, piemēram, tikai SARS-CoV-2 tapas proteīnam ir aptuveni 5000 iespējamie varianti.

Pārbaude tik plašam iespēju klāstamrada milzīgu izaicinājumu tradicionālajām eksperimentālajām metodēm, atzīmē zinātnieki. Datorsimulācijas priekšrocība ir tāda, ka dažās dienās var viegli novērtēt simts mutācijas.

Zinātnieki pievērsās skaitļošanas metodeikas modelē to, kā SARS-CoV-2 smailes proteīns atpazīst ACE2 receptoru — proteīnu uz daudzu šūnu tipu virsmas —, lai iekļūtu saimniekšūnās. Viņi novērtēja 1003 mutāciju kombinācijas koronavīrusa smailes proteīnos, tostarp tās, kas izraisīja infekciju pieaugums Brazīlijā, Dienvidāfrikā, Apvienotajā Karalistē un Indijā.

Sistemātisks iespēju novērtējums parādījaSpike mutācijas, kas cieši saistās ar ACE2 receptoru, notiek divās mutāciju kopās jeb "karstajos punktos" saistošajā saskarnē. Tie atrodas strukturāli elastīgos reģionos. Tas nozīmē, ka mutācijas, kas palielina saistīšanos, ir efektīvi pārprogrammējušas mugurkaula konformāciju, lai uzlabotu tā spēju atpazīt ACE2 receptorus.

Pētījums tika publicēts Molekulārās bioloģijas žurnāls.

Lasīt arī

Skyborg autonomais ASVF bezpilota lidaparāts veic pirmo lidojumu

Austrālijā tika atrasts milzīgs kode. Viņas spārnu platums ir 25 cm

Zinātnieki betona mājas ir pārvērtuši par baterijām