TALEN genoma rediģēšanas rīks 5 reizes pārsniedz CRISPR-Cas9

Trauslā X sindroms, sirpjveida šūnu anēmija, beta talasēmija un citas slimības ir

ģenētisku defektu rezultātsheterohromatīns. Pēc pētījuma veikšanas zinātnieki nonāca pie secinājuma, ka tik blīvi iesaiņotās genoma daļās TALEN rediģēšanas rīks ir efektīvāks par tradicionālo CRISPR/Cas9. Biologi ziņo par saviem atklājumiem žurnālāDabas komunikācijas.

Saskaņā ar Humin Zhao, ķīmijas unBiomolekulārajā inženierijā no Ilinoisas Universitātes Urbana-Champaign, kurš vadīja jauno pētījumu, atklājums apstiprina, ka ir nepieciešams plašāks genoma rediģēšanas rīku klāsts, lai aptvertu visas genoma daļas.

"CRISPR ir ļoti spēcīgs rīks, kas radikāli mainīja gēnu inženieriju," skaidro Džoo. "Bet viņam joprojām ir daži ierobežojumi."

Džo un viņa kolēģi izmantoja fluorescējošuvienas molekulas mikroskopija, lai tieši novērotu, kā dzīvu zīdītāju šūnās darbojas divi genoma rediģēšanas rīki. Fluorescējošie marķieri ļāva pētniekiem izmērīt, cik ilgs laiks bija vajadzīgs, lai CRISPR un TALEN pārvietotos pa DNS, kā arī atklātu un izgrieztu mērķa reģionus.

“Mēs atklājām, ka CRISPR darbojas labākmazāk neaizsargātos genoma reģionos, bet TALEN var piekļūt šiem gēniem heterohromatiskajā reģionā labāk nekā CRISPR, sacīja Džao. "Mēs arī redzējām, ka TALEN varētu būt augstāka rediģēšanas efektivitāte nekā CRISPR." Tas var samazināt DNS un pēc tam veikt izmaiņas efektīvāk."

Kopumā TALEN bija piecas reizesefektīvāka nekā CRISPR vairākos eksperimentos. Jebkurā gadījumā rezultāti ļaus uzlabot pieeju dažādu genoma daļu mērķēšanai, Zhao secina: "Vai nu mēs varam izmantot TALEN noteiktām lietojumprogrammām, vai arī mēs varam mēģināt uzlabot CRISPR veiktspēju ar heterohromatīnu."

Lasīt vairāk

Aborts un zinātne: kas notiks ar bērniem, kas dzemdēs

Radari ir atraduši pēdējo Tlingitas fortu Aļaskā. Viņi viņu meklēja vairāk nekā 100 gadus

Trešdaļa no tiem, kuri ir atveseļojušies pēc COVID-19, atgriežas slimnīcā. Katru astoto - nomirst

Ilinoisas Universitāte, Urbana-Champaign, UIUC- lielākā no Ilinoisas universitātes pilsētiņām. Dibināta 1867. gadā. Atrodas apvienotajās pilsētās Urbana un Champaign Ilinoisas centrā, ASV.

Heterohromatīns - hromatīna apgabali, kas šūnu cikla laikā atrodas kondensētā (kompaktā) stāvoklī. Heterohromatiskās DNS iezīme ir tās ārkārtīgi zemā pārrakstāmība.

Aktivatoram līdzīgas efektora nukleāzesTranskripcijas aktivatoram līdzīgas efektoru nukleāzes, TALEN, ir restrikcijas enzīmi, kurus var konstruēt, lai sagrieztu specifiskas DNS sekvences.

CRISPR - īpašas baktēriju un arheju lokācijas,kas sastāv no taisnām atkārtojošām sekvencēm, kas atdalītas ar unikālām sekvencēm. Atstarotāji tiek aizņemti no svešiem ģenētiskiem elementiem, ar kuriem šūna ir saskārusies.

Cas9 (CRISPR saistītais proteīns 9,Ar CRISPR saistītais proteīns) ir vadoša RNS kontrolēta endonukleāze, kas saistīta ar adaptīvo imūnsistēmu CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Palindromic Repeats) vairākās baktērijās, jo īpašiStreptococcus pyogenes.S. pyogenesizmanto Cas9, lai uzglabātu, pārbaudītu un sagrieztu svešu DNS, piemēram, bakteriofāgu vai plazmīdu DNS.