Een team onder leiding van RNA-wetenschapper Anne Marie Pyle heeft de meest uitgebreide kaart tot nu toe samengesteld
SARS-CoV-2 vertrouwt op zijn unieke eigenschappenRNA-structuren om mensen te infecteren en de ziekte van COVID-19 te veroorzaken. Maar de bijdrage van deze structuren aan de ontwikkeling van infecties en ziekten wordt zelfs door wetenschappers vaak onderschat, zegt Pyle, een onderzoeker aan het Howard Hughes Medical Institute aan de Yale University.
In alle opzichten, als we ons maar concentrerenop eiwitten die in het genoom van het virus zijn gecodeerd, zullen we begrijpen hoe SARS-CoV-2 werkt. Maar voor dit soort virussen kunnen de RNA-structuren in het genoom hun vermogen om te functioneren in dezelfde mate beïnvloeden als de gecodeerde eiwitten.
Anna Marie Pyle, onderzoeker aan het Howard Hughes Medical Institute van Yale University
Onderzoekers kunnen nu beginnen uit te zoeken hoedeze structuren helpen het virus. Deze informatie zou uiteindelijk kunnen leiden tot nieuwe behandelingen voor COVID-19. Nadat wetenschappers bijvoorbeeld de RNA-structuren hebben geïdentificeerd die sleuteltaken uitvoeren, is het mogelijk om manieren te ontwikkelen om deze te verstoren en infectie te voorkomen.
Het genoom van SARS-CoV-2, dat ongeveer 30.000 letters teltRNA ongebruikelijk lang voor een RNA-virus. Het omzetten van zijn RNA naar 3D-vorm geeft SARS-CoV-2 nog een set tools om een beperkt aantal genen te compenseren. "Het RNA-virus profiteert het meest van de manier waarop het zijn genoom gebruikt", zegt Pyle.
Ingekleurd elektronisch scannenmicrofoto van een cel (blauw) die zwaar geïnfecteerd is met SARS-CoV-2-virusdeeltjes (rood), geïsoleerd uit een patiëntenmonster. Foto genomen bij de NIAID Integrated Research Facility (IRF) in Fort Detrick, Maryland.
Krediet: NIAID
Volgens Jeffrey Keeft, StructuralRNA-bioloog en viroloog aan de Universiteit van Colorado, hebben wetenschappers een routekaart nodig voor het genomische landschap om elk RNA-virus te bestuderen, in het bijzonder SARS-CoV-2. "Dr. Pyle heeft een soort globale atlas gemaakt die een goed startpunt is voor de volgende ronde van meer gerichte experimenten", zegt hij. “In veel opzichten krabt deze studie aan de oppervlakte van de rijkdom van de RNA-structuur die waarschijnlijk aanwezig is in dit virus. Ik vermoed dat er veel verrassingen voor ons in petto zijn. "
Mapping vertegenwoordigt ookeen voorbereidende stap naar nieuwe medicijnen die de RNA-structuren van het virus kunnen aanvallen. De reis kan echter lang zijn. Sinds 2014, toen zijn lab een nodulaire structuur ontdekte die dengue- en West-Nijl-virussen gebruiken om cellulaire afweer te omzeilen, probeert Kieft een manier te vinden om deze te neutraliseren. Hij waarschuwt dat de onderzoeksgemeenschap niet volledig toegewijd is aan het identificeren van medicijnen die de RNA-structuur verstoren. "Deze strategie is niet op dezelfde manier bestudeerd en toegepast als voor eiwitten", zegt hij. Maar als je te maken hebt met een pandemisch virus zoals SARS-CoV-2, "probeer je alles".
Lees ook
De Andromeda-halo nadert onze melkweg. We vertellen je waarom het belangrijk is
Symptomen van coronavirus bij kinderen. Waar moet je op letten?
Het bleek dat de Maya-beschaving hun steden verliet