Wetenschappers van de interdisciplinaire onderzoeksgroep antimicrobiële resistentie (AMR) in
Afvalwatermonitoring helpt om snel enonopvallend de verspreiding van COVID-19 volgen. Met aanvullende informatie kunnen gezondheidsautoriteiten de pandemie op gemeenschapsniveau volgen. Meer recentelijk zijn SARS-CoV-2-virusfragmenten gevonden in woonwijken in Singapore als onderdeel van een proactief afvalwaterbewakingsprogramma. Dankzij deze informatie, samen met vervolgtesten, kon het ministerie van Volksgezondheid van het land snel op de situatie reageren.
Echter, de detectie van varianten van het coronavirus metafvalwatermonitoring komt minder vaak voor vanwege problemen met bestaande technologieën. De volgende generatie sequencing voor afvalwatermonitoring is tijdrovend en duur. De tests missen ook gevoeligheid. Een internationaal team van wetenschappers in een nieuwe studie probeerde dit probleem aan te pakken.
In een studie gepubliceerd intijdschrift Milieuwetenschappen & Technology Letters leggen wetenschappers een innovatieve moleculaire detectiemethode uit, gebaseerd op allelspecifieke RT-qPCR die de B.1.1.7 (Alpha) variant detecteert en kwantificeert. De ontwikkelde test, getest en gevalideerd op afvalwatermonsters van 19 Amerikaanse gemeenschappen, is in staat om op betrouwbare wijze lage niveaus van de B.1.1.7 (Alfa)-variant te detecteren en te kwantificeren met lage kruisreactiviteit en variantverhoudingen zo laag als 1 procent in gemengde SARS-virusachtergronden -CoV-2.
Een methode gericht op eiwitspike-mutaties die variant B.1.1.7 (Alpha) voorspellen, kan worden geïmplementeerd met behulp van in de handel verkrijgbare RT-qPCR-protocollen.
Lees verder
De vertraging van de rotatie van de aarde veroorzaakte het vrijkomen van zuurstof op de planeet
Astronomen ontdekken ongewone structuren in de verre ruimte
Bekijk meer 60.000 jaar oude Neanderthaler-rotstekeningen
AMR - Antimicrobiële resistentie
RT-qPCR - kwantitatieve PCR reverse transcriptie.