Wetenschappers hebben de vingerafdrukken ontdekt van mysterieuze virussen die zich verborgen hielden in een oude groep microben.
Deze week in het tijdschrift Nature Microbiologydrie artikelen gewijd aan virussen van de archaea van de Asgard-groep werden tegelijk gepubliceerd. Wetenschappers hebben de genomen van virussen onderzocht op basis van genomische en metagenomische gegevens en hun relatie met de meest bekende groepen virussen bestudeerd. De verkregen gegevens hielpen wetenschappers te raden wat precies de functies waren van de virussen die de Asgard-archaea infecteerden.
Dit is met name de eerste studiearchaeale Asgard-virussen; vroeger was er niets bekend. In de toekomst kan deze onderzoekslijn uitwijzen of en hoe virussen betrokken waren bij het ontstaan van eukaryote cellen op aarde.
Over het algemeen hebben de archaea van de Asgard-groep veel genendie coderen voor eukaryote eiwitten. Wetenschappers beschouwen ze ook als de naaste verwanten van eukaryoten. Tot nu toe wisten onderzoekers echter niet of de overeenkomsten tussen leden van de Asgard-groep en eukaryoten zich uitstrekten tot de virussen die hen infecteerden.
De eerste groep wetenschappers analyseerdemetagenomische sequenties. Ze werden verkregen uit hydrothermale afzettingen in de diepzee. Biologen hebben zes genomen van virussen verzameld die de archaea van de Asgard-groep infecteren. Het bleek dat ze tot vier virussen behoorden, ze heetten Fenrir (Fenrir), Sköll (Skoll), Nidhogg (Nidhogg) en Ratatoskr (Ratatoskr). Het zijn allemaal wezens uit de Scandinavische mythologie.
Op basis van genomische gegevens, biologensuggereerde dat ze in staat zijn tot semi-autonome genoomreplicatie, reparatie, epigenetische modificatie en transcriptionele regulatie. Ze combineren ook kenmerken van bacteriële en archaeale virussen.
Een andere groep wetenschappers heeft het volledige genoom van een archaea in handen gekregenuit de Asgard-groep en stelde het genoom van stam LCB_4 opnieuw samen, die werd beschouwd als een basale groep van de phylum Odinarchaeota. Biologen hebben de sequenties van twee virussen ontdekt, ze heetten Huginn en Muninn (Hugin en Munin zijn een paar raven in de Scandinavische mythologie die rond de wereld van Midgard vliegen en aan de god Odin rapporteren wat er gebeurt). Aan hen gerelateerde virussen werden gevonden in de genomen van andere prokaryoten, waaronder de archaea van de Asgard-groep.
Het derde werk is gewijd aan metagenomische assemblage 20nieuwe archaeale virussen van de Asgard-groep uit sedimentmonsters. Door fylogenetische analyse te combineren met zoekopdrachten naar CRISPR-loci in metagenomische gegevens, verdeelden de onderzoekers de gevonden virussen in drie groepen op familieniveau.
Uiteindelijk konden de onderzoekers de functies van slechts enkele virusgenen achterhalen. De functies van de overgrote meerderheid van genen zijn nog onbekend.
Asgard of Asgardarchaeota - verondersteldeen superphylum bestaande uit een groep archaea die Lokiarchaeota, Thorarchaeota, Odinarchaeota en Heimdallarchaeota omvat. Het lijkt erop dat eukaryoten hun oorsprong vonden in Asgard, in de tak met de Heimdallarchaeota. Dit betekent dat archaea uit de Asgard-groep, zo suggereren veel biologen, het dichtst bij de voorouders staan van alle organismen die celkernen hebben. Ze hadden kunnen bijdragen aan het ontstaan van complex leven
De onderzoeksresultaten zijn hier, hier en hier te vinden.
Lees verder:
Kijk naar de hemelse "Titanic" die op kernenergie zal draaien
NASA ontdekte hoe je naar leven op Mars moest zoeken: het experiment liet zien waar het zou kunnen zijn
Astronomen hebben planeten gevonden die verschillen van de aarde, maar geschikt zijn voor leven
</ p>