Nieuwe software vindt antibioticaresistente bacteriën die mens en dier infecteren

In een nieuwe studie onderzocht een team van experts een grote commerciële pluimveeboerderij in China en verzamelde er 154

monster van dieren, karkassen, werknemers en hun huisdierenboerderijen en het milieu. Uit de monsters isoleerden ze specifieke bacteriën Escherichia coli (E. coli). Ze kunnen volkomen ongevaarlijk leven in de menselijke darm, maar kunnen ook pathogeen zijn. En als hun genoom genen draagt ​​voor resistentie tegen bepaalde medicijnen, kan dit leiden tot de ontwikkeling van ernstige ziekten, waaronder ernstige maagkrampen, diarree en braken.

De onderzoekers gebruikten een computationele benaderingdat machinaal leren, volledige genoomsequencing, netwerken voor het delen van genen en mobiele genetische elementen combineert om de verschillende soorten ziekteverwekkers die op een boerderij voorkomen te karakteriseren. Ze ontdekten dat antimicrobiële genen (genen die resistentie tegen antibiotica verlenen) aanwezig zijn in zowel pathogene als niet-pathogene bacteriën.

Een nieuwe aanpak met behulp van machine learningHet stelde experts in staat het hele netwerk van genen bloot te leggen die geassocieerd zijn met antimicrobiële resistentie die voorkomt bij dieren, landarbeiders en het milieu. Dit netwerk omvatte met name genen waarvan bekend is dat ze resistentie tegen antibiotica veroorzaken, evenals nog onbekende genen die geassocieerd zijn met resistentie tegen geneesmiddelen.

Gebouwde omgevingen zoals gebiedenintensieve veehouderij worden beschouwd als ideale broedplaatsen voor antibioticaresistente bacteriën en antibioticaresistentiegenen. Hun studie is van groot belang voor de effectieve behandeling van bepaalde ziekten en infecties.

Lees verder

Er wordt al eeuwen op gejaagd: wat weten we over de planeet Vulcan naast de zon

Natuurkundigen hebben experimenteel een nieuwe fundamentele wet voor vloeistoffen bevestigd

Astronomen hebben de bron gevonden van mysterieuze radio-uitbarstingen die uit de ruimte komen