De auteurs ontwikkelden mini-antilichamen met behulp van software die voorspelt hoe
Dit is heel verbazingwekkend spul! Het opent vele mogelijkheden.
Stephen Mayo, scheikundige bij Caltech
Antilichamen binden goed aan eiwitten, b.v.met verschillende microben. Daarom gebruiken farmaceutische bedrijven ze als medicijnen om infecties en kanker te bestrijden. Maar antilichamen zijn grote eiwitten, dus ze zijn duur om te maken en het proces is vaak onstabiel. De auteurs van het onderzoek hebben geprobeerd deze problemen te overwinnen.
Het proces waarbij antilichamen aan een doelwit bindenziet eruit als een bergbeklimmer die een steile klif probeert te beklimmen, legt David Baker uit, een computationele structurele bioloog aan de Universiteit van Washington (UW). Het oppervlak van zo'n rots is meestal glad en er is weinig steun voor armen en benen. De antistoffen zijn groot, dus ze kunnen veel grepen tegelijk maken en stevig vasthouden.
Maar mini-antilichamen hebben minder mogelijkheden.De onderzoekers probeerden deze tekortkoming te overwinnen; ze identificeerden de vangplaatsen op de eiwitten en bouwden op basis hiervan mini-antilichamen. Maar dit werkt alleen voor goed bestudeerde eiwitten.
Om dit probleem te omzeilen, Baker en collega'swendden zich tot de Rosetta-software, die ze ontwikkelden om eiwitstructuren te voorspellen op basis van hun aminozuursequentie. Om een kaart van potentiële steunpunten te maken, heeft het team het programma de opdracht gegeven om te berekenen hoe strak gedefinieerde aminozuren zich zouden binden aan verschillende punten op het oppervlak van het doeleiwit. De onderzoekers gebruikten Rosetta om tienduizenden virtuele mini-antilichamen te maken.
Deze software zal toestaanonderzoekers om diagnostische sondes te ontwikkelen om ziekten in een vroeg stadium op te sporen, voegt Tanya Kortemme, een bio-ingenieur aan de Universiteit van Californië, San Francisco, toe.
We kunnen eiwitten ontwerpen omcontact opnemen met een willekeurig doel. Dit betekent dat mini-eiwitten niet alleen ziekteverwekkende eiwitten kunnen blokkeren, maar ook medicijnen naar kankerweefsels kunnen sturen of lichtemitterende of radioactieve diagnostische moleculen aan cellen kunnen leveren. Dit zal helpen om de voortgang van de behandeling te volgen.
Longxin Cao, UW-postdoc
Lees verder:
Het ‘vijfde element’ bestaat: een nieuw experiment zal bevestigen dat informatie materieel is
"James Webb" nam de duidelijkste foto van een ster in de geschiedenis
Quantum-opladen maakt recordbrekend snel opladen van elektrische voertuigen mogelijk