De TALEN-tool voor genoombewerking presteert 5 keer beter dan CRISPR-Cas9

Fragiele X-syndroom, sikkelcelanemie, bèta-thalassemie en andere ziekten zijn

Na het uitvoeren van een studie kwamen de wetenschappers tot de conclusie dat in zulke dicht opeengepakte delen van het genoom, de toolTALEN-bewerking is effectiever dan traditionele CRISPR/Cas9.De biologen rapporteren hun bevindingenIn het JournaalNature Communications.

Volgens Humin Zhao, een professor in chemische en biomoleculaire engineering aan de Universiteit van Illinois in Urbana-Champaign, die de nieuwe studie leidde, bevestigt de ontdekking"Er is een bredere selectie van genoombewerkingstools nodig om alle delen van het genoom te bestrijken.

"CRISPR is een zeer krachtig instrument dat een revolutie teweeg heeft gebracht in genetische manipulatie", legt Zhao uit. "Maar het heeft nog steeds enkele beperkingen."

Zhao en zijn collega's gebruikten fluorescentiemicroscopie van één molecuul om direct te observeren hoe twee tools voor genoombewerking werken in levende zoogdiercellen. Met de fluorescerende markers konden onderzoekers meten hoe lang het duurde voordat CRISPR en TALEN langs het DNA liepen, en konden ze doelgebieden detecteren en uitsnijden.

"We ontdekten dat CRISPR beter werkt in minder kwetsbare regio's van het genoom, maar TALEN kan dat wel "Toegang tot deze genen in het heterochromatinegebied is beter dan CRISPR," zei Zhao."We hebben ook gezien dat TALEN een hogere bewerkingsefficiëntie kan hebben dan CRISPR.Het kan het DNA knippen en vervolgens efficiënter veranderingen aanbrengen."

In totaal was TALEN vijf keereffectiever dan CRISPR in meerdere experimenten. In elk geval zullen de resultaten leiden tot verbeterde benaderingen om zich op verschillende delen van het genoom te richten, concludeert Zhao: "Of we kunnen TALEN gebruiken voor bepaalde toepassingen, of we kunnen proberen de CRISPR-prestaties te verbeteren met heterochromatine."

Lees verder

Abortus en wetenschap: wat gebeurt er met de kinderen die zullen bevallen

Radars hebben het laatste Tlingit-fort in Alaska gevonden. Ze zoeken hem al meer dan 100 jaar

Een derde van degenen die hersteld zijn van COVID-19 keert terug naar het ziekenhuis. Elke achtste - sterft

Universiteit van Illinois in Urbana-Champaign, UIUC- de grootste van de campussen van de Universiteit van Illinois. Opgericht in 1867. Gelegen in de samengevoegde steden Urbana en Champaign in het centrum van Illinois, VS.

Heterochromatine - gebieden van chromatine die zich tijdens de celcyclus in een gecondenseerde (compacte) toestand bevinden. Een kenmerk van heterochromatine-DNA is de extreem lage transcribeerbaarheid.

Transcriptieactivator-achtige effectornucleasen ( TALEN's) vertegenwoordigenzijn restrictie-enzymen die kunnen worden gemanipuleerd om specifieke DNA-sequenties te knippen.

CRISPR - speciale loci van bacteriën en archaea,bestaande uit rechte herhalende reeksen die worden gescheiden door unieke reeksen. Spacers worden geleend van vreemde genetische elementen die de cel is tegengekomen.

Cas9 (CRISPR-geassocieerd eiwit 9,CRISPR-geassocieerd eiwit) is een RNA-gecontroleerd endonuclease dat geassocieerd is met het adaptieve immuunsysteem CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Palindromic Repeats) in een aantal bacteriën, in het bijzonderStreptococcus pyogenes.S. pyogenesgebruikt Cas9 om vreemd DNA, zoals bacteriofaag- of plasmide-DNA, op te slaan, te inspecteren en te knippen.