De DeepMind-database bevatte bijna elk eiwit dat de wetenschap kent. Ongeveer 200 miljoen

Vorig jaar bracht DeepMind een open-sourcedatabase uit met honderdduizenden 3D-structuren

eiwitten, inclusief alle 20.000 bekende eiwittenmenselijk lichaam. Nu is deze AlphaFold Protein Structure Database uitgebreid tot 200 miljoen structuren, inclusief bijna alle in de wetenschap bekende eiwitten

Eiwitten zijn opgebouwd uit ketens van aminozuren dievouwen in ingewikkelde driedimensionale vormen die hun functie bepalen. Het in kaart brengen van de structuren van eiwitten is belangrijk om te begrijpen wat ze doen en hoe ze werken en hoe het mis kan gaan. Het is echter nog steeds moeilijk om de exacte structuur van een eiwit te berekenen op basis van de samenstellende aminozuren. Dit vereist meestal een enorme hoeveelheid rekenkracht en manuren.

Dit was het geval tot Alphabetheeft zijn krachtige kunstmatige intelligentie DeepMind aangestuurd om dit probleem op te lossen. Aanvankelijk getraind op 100.000 bekende eiwitstructuren, heeft het systeem het vermogen ontwikkeld om de structuren van vele miljoenen andere eiwitten te voorspellen, die elk minuten of seconden nodig hebben om te bepalen, in plaats van maanden of jaren.

Onlangs heeft DeepMind een nieuwe grootschaligehet bijwerken van de database, die nu ongeveer 214 miljoen structuren van een miljoen soorten bevat. Dit omvat bijna elk eiwit dat de wetenschap kent, wat een enorme hulp is voor onderzoek naar behandelingen voor ziekten, vaccins, antibioticaresistentie en zelfs plasticvervuiling.

De volledige eiwitstructuurdatabase van meer dan 25 terabyte aan gegevens kan worden gedownload van Google Cloud Public Datasets.