Det hittil mest komplette atlaset til coronavirus genomet er opprettet

Et team ledet av RNA-forsker Anne Marie Pyle har satt sammen det mest omfattende kartet til dags dato

genomiske strukturer av koronavirus. Forskere kartla strukturene til hele RNA-genomet til SARS-CoV-2 ved å bruke levende celler og dataanalyse.

SARS-CoV-2 er avhengig av det unikeRNA-strukturer for å infisere mennesker og forårsake COVID-19 sykdom. Men bidragene fra disse strukturene til utvikling av infeksjoner og sykdommer blir ofte undervurdert selv av forskere, sier Pyle, forsker ved Howard Hughes Medical Institute ved Yale University.

Av alle kontoer, hvis vi bare fokusererpå proteiner kodet i genomet til viruset, vil vi forstå hvordan SARS-CoV-2 fungerer. Men for denne typen virus kan RNA-strukturer i genomet påvirke deres evne til å fungere i samme grad som de kodede proteinene.

Anna Marie Pyle, forsker ved Howard Hughes Medical Institute ved Yale University

Forskere kan nå begynne å finne ut hvordandisse strukturene hjelper viruset. Denne informasjonen kan til slutt føre til nye behandlinger for COVID-19. For eksempel, etter at forskere har identifisert RNA-strukturer som utfører viktige oppgaver, vil det være mulig å utvikle måter å forstyrre dem og forhindre infeksjon.

Genomet til SARS-CoV-2, som nummererer rundt 30 000 bokstaverRNA er uvanlig lenge etter et RNA-virus. Konvertering av RNA til 3D-form gir SARS-CoV-2 et nytt sett med verktøy som kompenserer for et begrenset antall gener. "RNA-viruset har størst nytte av hvordan det bruker genomet sitt," sier Pyle.

Fargelagt elektronisk skanningmikrofotografi av en celle (blå) sterkt infisert med SARS-CoV-2-viruspartikler (rød), isolert fra en pasientprøve. Bildet er tatt ved NIAID Integrated Research Facility (IRF) i Fort Detrick, Maryland.
Kreditt: NIAID

I følge Jeffrey Keeft, StructuralEn RNA-biolog og virolog ved University of Colorado, forskere trenger en veikart for sitt genomiske landskap for å studere noe RNA-virus, spesielt SARS-CoV-2. "Dr. Pyle har skapt et slags globalt atlas som er et flott utgangspunkt for neste runde med mer målrettet eksperimentering," sier han. “På mange måter skraper denne studien overflaten av rikheten til RNA-strukturen som sannsynligvis vil eksistere i dette viruset. Jeg mistenker at det er mange overraskelser som venter på oss. "

Kartlegging representerer ogsået innledende skritt mot nye medisiner som kan målrette seg mot RNA-strukturene til viruset. Reisen kan imidlertid være lang. Siden 2014, da laboratoriet hans oppdaget en nodulær struktur som dengue- og West Nile-virus bruker for å omgå mobilforsvar, har Kieft forsøkt å finne en måte å nøytralisere den på. Han advarer om at forskningsmiljøet ikke er helt forpliktet til å identifisere medisiner som forstyrrer RNA-strukturen. "Denne strategien er ikke studert og brukt på samme måte som for proteiner," sier han. Men når du har å gjøre med et pandemivirus som SARS-CoV-2, "prøver du alt."

Les også

Andromeda-glansen nærmer seg vår galakse. Vi forteller deg hvorfor det er viktig

Symptomer på coronavirus hos barn. Hva du bør ta hensyn til?

Det viste seg at fikk mayasivilisasjonen til å forlate byene sine