Hva er den "britiske" stammen av koronavirus?
Stamme 202012/01 er en stamme av SARS-CoV-2-viruset som forårsaker COVID-19. Dette
I midten av desember begynte belastningen å bli rasktspre. Dette korrelerer med en betydelig økning i frekvensen av COVID-19-infeksjoner i Storbritannia; denne økningen antas å være i det minste delvis på grunn av N501Y-mutasjonen i det reseptorbindende domenet til spike-glykoproteinet, som binder seg til ACE2-reseptoren i humane celler.
Stammen er også kjent for et stort antall mutasjoner sammenlignet med den kjente SARS-CoV-2 mutasjonstrenden per desember 2020.
Stammen er kjent under flere navn. Det blir ofte referert til som "den britiske stammen av COVID-19" og "den britiske stammen av koronavirus" i offentlig kommunikasjon og media.
Denne stammen ble tidligere kalt "den første stammenunder vurdering i desember 2020 (VUI - 202012/01) av Public Health England, men ble nedgradert til en Strain of Concern av Meera Chand og kolleger i en rapport publisert av Public Health England 21. desember 2020.
I en rapport skrevet på vegne av konsortietGenomics COVID-19 UK (COG-UK) Andrew Rambeau og hans medforfattere refererte til denne stammen som avstamning B.1.1.7. CDC kaller også denne stammen 20B / 501Y.V1.
Land med bekreftede tilfeller av VOC-2020/12/01
Hvor kom han fra?
Tilsynelatende fra Sør-Afrika.Den første rapporten om denne stammen ble publisert av en gruppe lokale biologer ledet av da Oliveira 22. desember 2020 - prøver ble samlet inn tidlig i oktober. Siden ikke alle land har overvåkningsprogrammer for nye stammer, beviser selvfølgelig ikke den aller første påvisningen i et land at en variant har sin opprinnelse akkurat der den ble funnet.
Egenskaper til den "britiske" stammen
- Genetikk
Mutasjoner i SARS-CoV-2-viruset skjer ganskeOfte: I henhold til COVID-19 Genomics Consortium of Great Britain (COG-UK) har det blitt funnet mer enn 4000 mutasjoner i piggen glykoprotein alene i forskjellige stammer av dette viruset.
Stamme VOC-202012/01 er definert av 23 mutasjoner: 13 ikke-synonyme mutasjoner, 4 deletjoner og 6 synonyme mutasjoner (dvs. 17 mutasjoner endrer proteiner, og 6 gjør det ikke).
- Overførbarhet
Det britiske vitenskapelige rådgivende organet NERVTAG(Advisory Group on New and Emerging Respiratory Viruses) konkluderte 18. desember 2020 med at de har moderat tillit til at VUI-202012/01 er betydelig mer overførbar enn andre stammer, med data som ennå ikke er tilstrekkelig til å trekke definitive konklusjoner om den underliggende mekanismen for økt overførbarhet.
Data innhentet av NERVTAG viste at dettestamme har en "seleksjonskoeffisient" på 0,70 (70%), forutsatt et generasjonsintervall på 6,5 dager. Senere arbeid brukte det relative antallet reproduksjoner som et mål, som er en indikator på seleksjonskoeffisienten.
Basert på litt forskjellige data ble det relative antallet reproduksjoner («multiplikativ fordel») bestemt til å være 1,74 (dette betyr at denne stammen er 74 % mer overførbar).
Denne stammen har blitt dominerende i London, ogi øst og sørøst i England i en til to måneder. Tilsvarende rask vekst er observert i Irland, og det ser ut til at denne stammen snart vil bli dominerende også der.
USA skal gjøre det sammei mars. Bølgen i SARS-CoV-2-infeksjoner ved begynnelsen av det nye året blir sett på som et resultat av stammens økte overførbarhet, mens forekomsten av andre stammer synker. Dette krever strammere grenser for å unngå en rask eksponentiell økning i infeksjoner. Overføringskontroll av denne belastningen ser i sin tur stadig svakere ut.
Første bilde av en britisk virusstamme
Er vaksiner effektive mot det?
Flere COVID-19-vaksiner har blitt utviklet tidligere.
Men etter hvert som det skjer mermutasjoner, kan det hende at vaksinen må modifiseres. SARS-CoV-2 muterer ikke like raskt som for eksempel influensavirus, og de nye vaksinene som ble bevist effektive ved utgangen av 2020 er typer som kan modifiseres om nødvendig.
Fra slutten av 2020, organerhelseeksperter og eksperter fra Tyskland, Storbritannia og Amerika mener at eksisterende vaksiner vil være like effektive mot VOC-202012/01-stammen som mot tidligere stammer.
18. desember 2020 konkluderte NERVTAG med at "det for øyeblikket ikke er tilstrekkelige data til å trekke noen konklusjon om denne stammens ufølsomhet for vaksineantigener."
Så langt offentlig helsetjenesteStorbritannia har bekreftet at det ikke er "bevis" for at den nye stammen vil være motstandsdyktig mot Pfizer-BioNTech-vaksinen som for tiden brukes i det britiske vaksinasjonsprogrammet, så vaksinerte mennesker er fortsatt beskyttet.
Hva er spesielt med den "britiske" stammen?
Generelt har den "britiske" stammen 29 mutasjoner isammenlignet med den opprinnelige Wuhan-stammen. Dette antyder at den muterer mye raskere enn sistnevnte, som virologer har registrert omtrent to mutasjoner for hver måned.
Dessuten er det mange mutasjoner som finnes i proteinettorner av den nye stammen, letter bindingen av viruset til reseptorene til vertscellene. Derfor foreslår forskere at B.1.1.7-stammen vil være farligere - den vil ha høyere virulens og muligens evnen til å unngå virkningen av de utviklede vaksinene.
I en ny studie bestemte forfatterne seg for å brukedatasimuleringer for å forutsi hvordan forskjellige mutasjoner av den "britiske" stammen vil påvirke smittens spredningshastighet og alvorlighetsgrad, samt replikering og patogenese av selve viruset.
For å forklare den uvanlig høye frekvensen av mutasjoner som forekommer i både S-piggproteinet og det N-terminale domenet, gir forskerne tre forklaringer:
- langvarig infeksjon med viruset hos en pasient med et svekket immunsystem tillot viruset å mutere i høy hastighet;
- adaptive mutasjoner begynte i dyreverter, ble overført til mennesker gjennom zoonotisk overføring og fortsatte i den menneskelige verten;
- selektivt utvalg som forekommer i strukturen til viruset under trykk fra antistoffer.
Simuleringsresultatene viste detstabiliteten til hydrogenbindinger i den mutante varianten er høyere. Dens toppprotein danner også flere bindinger med reseptoren til vertsceller, og disse bindingene vedvarer over lengre tid. Den estimerte overføringshastigheten for stamme B.1.1.7 er 70% høyere og antall reproduksjoner er 0,4 høyere enn for den klassiske varianten.
Faren ligger ifølge forfatterne også iat ved å teste standarder, gjenkjenner revers transkripsjonspolymerasekjedereaksjon, eller RT-PCR, kanskje ikke det virale RNA til den nye stammen. En mutasjonsendret stamme kan også tillate den å unngå nøytralisering av antistoffer og redusere effektiviteten til vaksiner.
Hvor distribueres den?
Nå - praktisk talt over hele verden.I følge den største databasen over genomene GISAID, ble de fleste av de tilsvarende prøvene funnet i Storbritannia, Danmark, USA, Frankrike, Spania og Irland. Det er genomer til og med fra relativt velstående land som New Zealand og Singapore. Distribusjonskartene kan vises her.
Med tilstedeværelsen av belastningen i Russland er ikke situasjonen heltklar. 10. januar rapporterte Anna Popova om oppdagelsen i landet. Imidlertid, i den største åpne internasjonale databasen GISAID av genomer av variant B.1.1.7. fra Russland nr.
Les mer
Se på et bilde på 8 billioner piksler av Mars
Forskere har utviklet en erstatning for relativitetsteorien. Hva er essensen av "teorien om alt"?
Abort og vitenskap: hva vil skje med barna som skal føde