Forskere fra den tverrfaglige forskningsgruppen om antimikrobiell resistens (AMR) i
Avløpsvannsovervåking hjelper til raskt ogspore diskret spredningen av COVID-19. Tilleggsinformasjon lar helsemyndigheter spore pandemien på samfunnsnivå. Nylig har SARS-CoV-2-virusfragmenter blitt funnet i boligområder i Singapore som en del av et proaktivt overvåkingsprogram for avløpsvann. Denne informasjonen, sammen med oppfølgingstesting, gjorde at landets helsedepartement kunne reagere raskt på situasjonen.
Imidlertid påvises varianter av koronaviruset medovervåkning av avløpsvann er mindre vanlig på grunn av problemer med eksisterende teknologi. Neste generasjons sekvensering for overvåkning av avløpsvann er tidkrevende og kostbar. Testene mangler også sensitivitet. Et internasjonalt team av forskere i en ny studie søkte å takle dette problemet.
I en studie publisert itidsskrift Environmental Science & Technology Letters, forskere forklarer en innovativ molekylær deteksjonsmetode basert på allelspesifikk RT-qPCR som oppdager og kvantifiserer B.1.1.7 (Alpha)-varianten. Den utviklede analysen, testet og validert på avløpsvannprøver fra 19 amerikanske samfunn, er i stand til pålitelig å oppdage og kvantifisere lave nivåer av B.1.1.7 (Alpha)-varianten med lav kryssreaktivitet og variantproporsjoner så lave som 1 prosent i blandet SARS-virusbakgrunn -CoV-2.
En metode rettet mot proteinpikemutasjoner som forutsier variant B.1.1.7 (Alpha) kan implementeres ved bruk av kommersielt tilgjengelige RT-qPCR-protokoller.
Les mer
Bremsingen av jordens rotasjon forårsaket frigjøring av oksygen på planeten
Astronomer oppdager uvanlige strukturer i dypt rom
Se mer 60.000 år gammel neandertalert rockekunst
AMR - Antimikrobiell resistens
RT -qPCR - kvantitativ PCR revers transkripsjon.