AI hjelper med å gjenkjenne RNA-rester av eldgamle virus i det menneskelige genomet

Tidligere studier har vist at når viruset kommer inn i menneskekroppen (og andre dyrs) kropp, er det

 kan endre vertens DNA ved å legge til en delsitt eget RNA. Det er også kjent at eldgamle virus som infiserte befolkningen for mange år siden noen ganger etterlot rester av deres RNA i det menneskelige genomet. Å finne dem viste seg imidlertid å være en vanskelig oppgave på grunn av det enorme antallet sammenligninger som kreves for hvert "mistenkt" virus. I det nye arbeidet brukte forskerne en maskinlæringsalgoritme for å løse problemet.

For å trene algoritmen brukte forskere RNA frakjente ikke-retrovirale endogene RNA-virale elementer. Ved å trene algoritmen til moderne viral RNA, kunne systemet få en følelse av hvordan det ser ut som en helhet. Forskere mener at slike likheter sannsynligvis også eksisterte i gammelt RNA. Etter opplæring justerte forskere systemet for å forhindre så mange falske positive som mulig. De kjørte den på det menneskelige genomet og fant omtrent 100 alternativer for videre vurdering. Etter å ha undersøkt dem, fant forskerne at mange av dem allerede var kjent, og noen var under terskelen de satte som et bestått / ikke-godkjent alternativ. De har bare en mulig rest av et ukjent virus igjen.

Senere sjekket forskere om de fant det sammegjenværende viralt RNA i genomene til andre arter, slik som aper og sjimpanser. Denne oppdagelsen antyder at infeksjonen og ytterligere DNA-endring skjedde for minst 43 millioner år siden.

Forskerne bemerket at mer informasjon om eldgamle virus og deres innvirkning på det menneskelige genomet vil gi innsikt i nyansene i oppførselen til moderne virus som fremdeles er ukjente.

Les mer

Abort og vitenskap: hva vil skje med barna som skal føde

Radarer har funnet det siste Tlingit-fortet i Alaska. De har lett etter ham i over 100 år

En tredjedel av dem som har kommet seg etter COVID-19, kommer tilbake til sykehuset. Hver åttende - dør