Forskere har oppdaget fingeravtrykk av mystiske virus som gjemte seg i en eldgammel gruppe mikrober.
Denne uken i tidsskriftet Nature Microbiologytre artikler viet til virus fra archaea fra Asgard-gruppen ble publisert på en gang. Forskere har undersøkt genomene til virus fra genomiske og metagenomiske data og studert deres forhold til de mest kjente gruppene av virus. Dataene som ble innhentet hjalp forskere til å gjette nøyaktig hva funksjonene til virusene som infiserte Asgard-arkaea var.
Spesielt er dette den første studienarkeiske Asgard-virus; ingenting var kjent fra før. I fremtiden kan denne forskningslinjen vise om og hvordan virus var involvert i fremveksten av eukaryote celler på jorden.
Generelt har arkeene til Asgard-gruppen mange genersom koder for eukaryote proteiner. Forskere anser dem også for å være de nærmeste slektningene til eukaryoter. Men inntil nå har forskerne ikke visst om likhetene mellom medlemmer av Asgard-gruppen og eukaryoter utvidet seg til virusene som infiserer dem.
Den første gruppen av forskere analysertemetagenomiske sekvenser. De ble hentet fra dypvanns hydrotermiske avsetninger. Biologer har samlet seks genomer av virus som infiserer arkeene til Asgard-gruppen. Det viste seg at de tilhører fire virus, de ble kalt Fenrir (Fenrir), Sköll (Skoll), Nidhogg (Nidhogg) og Ratatoskr (Ratatoskr). Alle er skapninger fra skandinavisk mytologi.
Basert på genomiske data, biologerantydet at de er i stand til semi-autonom genomreplikasjon, reparasjon, epigenetisk modifikasjon og transkripsjonsregulering. De kombinerer også trekk ved bakterielle og arkeale virus.
En annen gruppe forskere har fått det komplette genomet til en arkeafra Asgard-gruppen og satt sammen genomet til stamme LCB_4, som ble ansett som en basalgruppe av phylum Odinarchaeota. Biologer har oppdaget sekvensene til to virus, de ble kalt Huginn og Muninn (Hugin og Munin er et ravnepar i skandinavisk mytologi som flyr rundt i Midgards verden og rapporterer til guden Odin om hva som skjer). Beslektede virus ble funnet i genomene til andre prokaryoter, inkludert archaea fra Asgard-gruppen.
Det tredje verket er viet metagenomisk montering 20nye arkeale virus fra Asgard-gruppen fra sedimentprøver. Ved å kombinere fylogenetisk analyse med søk etter CRISPR loci i metagenomiske data, delte forskerne virusene som ble funnet i tre grupper på familienivå.
Til syvende og sist klarte forskerne å finne ut funksjonene til bare noen av virusgenene. Funksjonene til de aller fleste gener er fortsatt ukjente.
Asgard eller Asgardarchaeota - antattet superfylum som består av en gruppe archaea som inkluderer Lokiarchaeota, Thorarchaeota, Odinarchaeota og Heimdallarchaeota. Det ser ut til at eukaryoter har sin opprinnelse i Asgard, i grenen som inneholder Heimdallarchaeota. Dette betyr at arkea fra Asgard-gruppen, antyder mange biologer, er nærmest forfedrene til alle organismer som har cellekjerner. De kunne ha bidratt til fremveksten av komplekst liv
Forskningsresultatene finner du her, her og her.
Les mer:
Se på den himmelske "Titanic" som vil gå på atomkraft
NASA fant ut hvordan de skulle lete etter liv på Mars: eksperimentet viste hvor det kunne være
Astronomer har funnet planeter som er forskjellige fra jorden, men egnet for liv
</ p>