Verktøyet utviklet av teamet heter CShaper.
Det er et kraftig dataverktøy som kan
systematisk segmentere og analysere cellebilder på nivå med spesifikke representanter. Dette er svært viktig for å studere celledeling, samt celle- og genfunksjoner.Arbeidstekst
For å lage en datamaskinenhet, har biologer studert hvordan dyr vokser fra en enkelt celle, et befruktet egg eller gjennom utallige celledelinger. Spesielt ønsket de å vite visse genfunksjoner, som hvilke gener som er involvert i celledeling for å danne ulike organer eller hva som forårsaker unormale celledelinger som får svulster til å vokse.
For å gjøre dette fikk forskerne førstbilder av celler - deres "slektstre". De "slår ut" (fjerner) genet fra DNA-sekvensen og sammenligner de to avstamningstrærne for å analysere endringer i celler og utlede genfunksjonen. Etter dette gjentas forsøket, men med andre gener.
Biologer brukte embryoer i studienCaenorhabditis elegans er en type orm som deler mange biologiske egenskaper med mennesker, så den kan brukes til å studere svulstvekst hos mennesker.
«Учитывая, что у C. elegans около 20 000 генов, это означает, что потребуется почти 20 000 экспериментов, если вы выберете по одному гену за раз. Это будет огромное количество данных. Поэтому крайне важно использовать автоматизированную систему анализа изображений, которую мы разработали», — текст исследования.
Cellebilder oppnås vanligvis ved hjelp avskanning med en laserstråle. Eksisterende bildeanalysesystemer kan bare oppdage cellekjernen, men bildet av cellemembranen vil ha dårlig kvalitet, noe som gjør det vanskelig å rekonstruere celleformen.
Dessuten er det ingen pålitelig algoritme forsegmentering av time-lapse tredimensjonale bilder (dvs. firedimensjonale bilder) av celledeling. Bildesegmentering er en viktig prosess i datasyn som innebærer å dele visuelle input i segmenter for å lette bildeanalyse. Men forskere må bruke hundrevis av timer på å manuelt merke mange bilder av celler.
Новая разработка CShaper может обнаруживать клеточные мембраны, создавать формы клеток в трехмерном пространстве и, что более важно, автоматически сегментировать изображения клеток на уровне клеток.
Les mer
Farlig klimaoppvarming vil begynne om 7 år
Abort og vitenskap: hva vil skje med barna som skal føde
Sjekk ut de vakreste bildene av Hubble. Hva har teleskopet sett på 30 år?