Ny programvare finner antibiotikaresistente bakterier som infiserer mennesker og dyr

I en ny studie undersøkte et team av eksperter en stor kommersiell fjørfefarm i Kina og samlet inn 154

prøve fra dyr, kadaver, arbeidere, deres kjæledyrgårder og miljø. Fra prøvene isolerte de spesifikke bakterier Escherichia coli (E. coli). De kan leve helt ufarlig i menneskets tarm, men kan også være sykdomsfremkallende. Og hvis genomet deres bærer gener for resistens mot visse legemidler, kan dette føre til utvikling av alvorlige sykdommer, inkludert alvorlige magekramper, diaré og oppkast.

Forskerne brukte en beregningsmessig tilnærmingsom kombinerer maskinlæring, helgenomsekvensering, gendelingsnettverk og mobile genetiske elementer for å karakterisere de forskjellige typene patogener som finnes på en gård. De fant at antimikrobielle gener (gener som gir resistens mot antibiotika) er tilstede i både patogene og ikke-patogene bakterier.

En ny tilnærming ved hjelp av maskinlæringtillot eksperter å avdekke hele nettverket av gener knyttet til antimikrobiell resistens som er vanlig for dyr, gårdsarbeidere og miljøet. Spesielt inkluderte dette nettverket gener kjent for å forårsake antibiotikaresistens, så vel som ennå ukjente gener assosiert med medikamentresistens.

Byggede miljøer som områderintensiv husdyrproduksjon anses som ideelle oppvekstplasser for antimikrobielle resistente bakterier og antibiotikaresistensgener. Studien deres er av stor betydning for effektiv behandling av visse sykdommer og infeksjoner.

Les mer

Den har blitt jaktet på i århundrer: hva vet vi om planeten Vulcan ved siden av solen

Fysikere har eksperimentelt bekreftet en ny grunnleggende lov for væsker

Astronomer har funnet kilden til mystiske radioutbrudd som kommer fra verdensrommet