Prosjektet bruker Perturb-seq-tilnærmingen, som lar deg spore virkningen av å slå på eller av
Når du arbeider med Perturb-seq-teknologiforskere gjør genetiske endringer i celler ved hjelp av CRISPR-Cas9 og bruker deretter encellet RNA-sekvensering for å samle informasjon om RNA som uttrykkes som et resultat av den genetiske endringen. Forskerne bemerker at RNA kontrollerer alle aspekter av celleadferd, så denne metoden hjelper til med å tyde de fleste cellulære effektene av minimale genetiske endringer.
I en ny studie brukte forskerehumane blodkreftcellelinjer, så vel som netthinneavledede ikke-kreftceller, for å utføre Perturb-seq på mer enn 2,5 millioner celler. Basert på dataene som ble oppnådd, bygde genetikere et omfattende kart som kobler genotyper med fenotyper.
Forfatterne mener at resultatene av prosjektet vil hjelpefremtidig forskning. For eksempel brukte skaperne av det integrerte kartet selv dataene til å studere de cellulære effektene av gener med ukjente funksjoner, for å studere responsen til mitokondrier på stress, og for å screene for gener som forårsaker tap eller økning av kromosomer, en fenotype som har vært vanskelig å studere tidligere.
"Jeg tror dette datasettet vil tillate alle slags analyser som vi ikke engang har tenkt på ennå, til folk som kommer fra forskjellige områder av biologi," sier Tom Norman, medforfatter av studien.
Les mer
Japanerne dumpet en gigantisk turbin i havet for å få endeløs energi fra strømmen.
Det er en måte å forbedre fusjon på: det er en kilde til uendelig energi
Astronomer fra Japan har funnet en ukjent struktur i galaksen