Zespół kierowany przez badaczkę RNA Anne Marie Pyle opracował najbardziej wszechstronną jak dotąd mapę
SARS-CoV-2 opiera się na jego wyjątkowościStruktury RNA do zakażania ludzi i wywoływania choroby COVID-19. Jednak wkład tych struktur w rozwój infekcji i chorób jest często niedoceniany nawet przez naukowców, mówi Pyle, badacz z Instytutu Medycznego Howarda Hughesa na Uniwersytecie Yale.
Oczywiście, jeśli tylko się skupimyna białkach kodowanych w genomie wirusa zrozumiemy, jak działa SARS-CoV-2. Ale w przypadku tego typu wirusów struktury RNA w genomie mogą wpływać na ich zdolność do funkcjonowania w takim samym stopniu, jak kodowane białka.
Anna Marie Pyle, badaczka w Instytucie Medycznym Howarda Hughesa na Uniwersytecie Yale
Naukowcy mogą teraz zacząć zastanawiać się, jak to zrobićstruktury te pomagają wirusowi. Te informacje mogą ostatecznie doprowadzić do nowych metod leczenia COVID-19. Na przykład po zidentyfikowaniu przez naukowców struktur RNA, które wykonują kluczowe zadania, możliwe będzie opracowanie sposobów ich niszczenia i zapobiegania infekcjom.
Genom SARS-CoV-2, liczący około 30 000 literRNA jest niezwykle długie jak na wirusa RNA. Konwersja jego RNA do postaci 3D daje SARS-CoV-2 kolejny zestaw narzędzi do kompensacji ograniczonej liczby genów. „Wirus RNA przynosi największe korzyści pod względem wykorzystania genomu” - mówi Pyle.
Kolorowe skanowanie elektronicznemikrofotografia komórki (kolor niebieski) silnie zakażonej cząsteczkami wirusa SARS-CoV-2 (kolor czerwony), wyizolowanej z próbki pacjenta. Zdjęcie zrobione w Zintegrowanym Ośrodku Badawczym NIAID (IRF) w Fort Detrick w stanie Maryland.
Kredyt: NIAID
Według Jeffrey Keeft, StructuralBiolog RNA i wirusolog z University of Colorado, naukowcy potrzebują mapy drogowej dla swojego krajobrazu genomowego, aby zbadać dowolny wirus RNA, w szczególności SARS-CoV-2. „Dr Pyle stworzył rodzaj globalnego atlasu, który jest świetnym punktem wyjścia do następnej rundy bardziej ukierunkowanych eksperymentów” - mówi. „Pod wieloma względami to badanie zarysowuje powierzchnię bogactwa struktury RNA, która prawdopodobnie istnieje w tym wirusie. Podejrzewam, że czeka nas wiele niespodzianek ”.
Mapowanie również reprezentujewstępny krok w kierunku nowych leków, które mogą celować w struktury RNA wirusa. Jednak podróż może być długa. Od 2014 roku, kiedy jego laboratorium odkryło guzkową strukturę, której wirusy denga i Zachodniego Nilu używają do omijania mechanizmów obronnych komórkowych, Kieft próbował znaleźć sposób na jej zneutralizowanie. Ostrzega, że społeczność badawcza nie jest w pełni zaangażowana w identyfikację leków, które zakłócają strukturę RNA. „Ta strategia nie była badana i stosowana w taki sam sposób, jak w przypadku białek” - mówi. Jednak mając do czynienia z wirusem pandemicznym, takim jak SARS-CoV-2, „próbujesz wszystkiego”.
Czytaj także
Halo Andromedy zbliża się do naszej galaktyki. Powiemy Ci, dlaczego jest to ważne
Objawy koronawirusa u dzieci. Na co powinieneś zwrócić uwagę?
Okazało się, że cywilizacja Majów opuściła swoje miasta