Jaki jest „brytyjski” szczep koronaawirusa?
Szczep 202012/01 to szczep wirusa SARS-CoV-2 wywołujący chorobę COVID-19. Ten
W połowie grudnia napięcie zaczęło gwałtownie rosnąćrozpowszechnianie się. Koreluje to ze znacznym wzrostem wskaźnika zakażeń COVID-19 w Wielkiej Brytanii; Uważa się, że wzrost ten jest przynajmniej częściowo spowodowany mutacją N501Y w domenie wiążącej receptor glikoproteiny kolczastej, która wiąże się z receptorem ACE2 w komórkach ludzkich.
Szczep wyróżnia się również dużą liczbą mutacji w porównaniu ze znanym trendem mutacji SARS-CoV-2 z grudnia 2020 r.
Odmiana znana jest pod kilkoma nazwami. W komunikatach rządowych i mediach powszechnie określa się go jako „brytyjski szczep wirusa Covid-19” i „brytyjski szczep wirusa”.
Szczep ten był wcześniej nazywany „pierwszym szczepem”.w trakcie przeglądu w grudniu 2020 r. (VUI – 202012/01) przez Public Health England, ale Meera Chand i współpracownicy obniżyli jego ocenę do kategorii budzącej obawy w raporcie opublikowanym przez Public Health England w dniu 21 grudnia 2020 r.
W raporcie napisanym w imieniu KonsorcjumGenomics COVID-19 UK (COG-UK) Andrew Rambeau i jego współautorzy określili ten szczep jako linię B.1.1.7. CDC nazywa ten szczep również 20B / 501Y.V1.
Kraje z potwierdzonymi przypadkami LZO-2020/12/01
Skąd on pochodzi?
Najwyraźniej z RPA.Pierwszy raport na temat tego szczepu został opublikowany przez grupę lokalnych biologów pod kierownictwem da Oliveira 22 grudnia 2020 r. - próbki pobrano na początku października. Ponieważ nie wszystkie kraje mają programy nadzoru nowych szczepów, pierwsze wykrycie w danym kraju oczywiście nie dowodzi, że wariant pochodzi z dokładnego miejsca, w którym został znaleziony.
Właściwości szczepu „brytyjskiego”.
- Genetyka
Mutacje w wirusie SARS-CoV-2 zdarzają się dośćCzęsto: Według brytyjskiego konsorcjum COVID-19 Genomics Consortium (COG-UK), w samej glikoproteinie kolców znaleziono ponad 4000 mutacji w różnych szczepach tego wirusa.
Szczep VOC-202012/01 jest definiowany przez 23 mutacje: 13 niesynonimicznych mutacji, 4 delecje i 6 synonimicznych mutacji (tj. 17 mutacji zmienia białka, a 6 nie).
- Przenoszenie
Brytyjski naukowy organ doradczy NERVTAG(Grupa Doradcza ds. Nowych i Pojawiających się Wirusów Układu Oddechowego) stwierdziła w dniu 18 grudnia 2020 r., że ma umiarkowaną pewność, że VUI-202012/01 jest znacznie bardziej przenoszony niż inne szczepy, przy czym dane nie są jeszcze wystarczające, aby wyciągnąć ostateczne wnioski na temat mechanizmu leżącego u podstaw zwiększonego transmitowalność.
Dane uzyskane przez NERVTAG wykazały, że takszczep ma „współczynnik selekcji” 0,70 (70%), przy założeniu przerwy między pokoleniami wynoszącej 6,5 dnia. W późniejszych pracach jako miarę wykorzystano względną liczbę reprodukcji, która jest wskaźnikiem współczynnika selekcji.
Na podstawie nieco innych danych względna liczba reprodukcji („przewaga multiplikatywna”) została określona na 1,74 (oznacza to, że szczep ten jest o 74% bardziej zaraźliwy).
Szczep ten stał się dominujący w Londynie iwe wschodniej i południowo-wschodniej Anglii przez jeden do dwóch miesięcy. Podobny szybki wzrost zaobserwowano w Irlandii i wygląda na to, że szczep ten wkrótce stanie się tam dominujący.
Stany Zjednoczone mają zrobić to samow marcu. Wzrost liczby zakażeń SARS-CoV-2 na początku nowego roku jest postrzegany jako wynik zwiększonej zdolności przenoszenia się tego szczepu, podczas gdy częstość występowania innych szczepów spada. Wymaga to ściślejszych granic, aby uniknąć gwałtownego wykładniczego wzrostu infekcji. Z kolei kontrola transmisji tego szczepu wygląda na coraz słabszą.
Pierwsze zdjęcie brytyjskiego szczepu wirusa
Czy szczepionki są przeciwko temu skuteczne?
W przeszłości opracowano kilka szczepionek COVID-19.
Jednakże, gdy dzieje się więcejmutacje, szczepionka może wymagać modyfikacji. SARS-CoV-2 nie mutuje tak szybko, jak na przykład wirusy grypy, a nowe szczepionki, których skuteczność została udowodniona do końca 2020 r., można w razie potrzeby modyfikować.
Według stanu na koniec 2020 r. Organyeksperci ds. zdrowia i eksperci z Niemiec, Wielkiej Brytanii i Ameryki uważają, że istniejące szczepionki będą równie skuteczne przeciwko szczepowi VOC-202012/01, jak w przypadku poprzednich szczepów.
18 grudnia 2020 r. NERVTAG stwierdził, że „obecnie nie ma wystarczających danych, aby wyciągnąć jakiekolwiek wnioski dotyczące niewrażliwości tego szczepu na antygeny szczepionkowe”.
Jak dotąd publiczna służba zdrowiaWielka Brytania potwierdziła, że „nie ma dowodów” na to, że nowy szczep będzie odporny na szczepionkę Pfizer-BioNTech, która jest obecnie stosowana w programie szczepień w Wielkiej Brytanii, więc zaszczepione osoby są nadal chronione.
Co jest specjalnego w „brytyjskiej” odmianie?
Ogólnie „brytyjski” szczep ma 29 mutacjiw porównaniu z oryginalnym szczepem Wuhan. Sugeruje to, że mutuje znacznie szybciej niż ta druga, dla której wirusolodzy odnotowali około dwóch mutacji miesięcznie.
Ponadto w białku występuje wiele mutacjiciernie nowego szczepu ułatwiają wiązanie wirusa z receptorami komórek żywiciela. Dlatego naukowcy sugerują, że szczep B.1.1.7 będzie bardziej niebezpieczny - będzie miał wyższą wirulencję i być może zdolność do unikania działania opracowanych szczepionek.
W nowym badaniu autorzy zdecydowali się na użyciesymulacje komputerowe w celu przewidzenia, jak różne mutacje szczepu „brytyjskiego” wpłyną na tempo rozprzestrzeniania się i nasilenie infekcji, a także na replikację i patogenezę samego wirusa.
Aby wyjaśnić niezwykle wysoką częstotliwość mutacji występujących zarówno w białku wypustowym S, jak i w domenie N-końcowej, naukowcy podają trzy wyjaśnienia:
- długotrwałe zakażenie wirusem u pacjenta z osłabionym układem odpornościowym umożliwiło wirusowi mutację z dużą szybkością;
- mutacje adaptacyjne rozpoczęły się u żywicieli zwierzęcych, zostały przeniesione na ludzi w wyniku przeniesienia odzwierzęcego i były kontynuowane w żywicielu ludzkim;
- selektywna selekcja, która występuje w strukturze wirusa pod presją przeciwciał.
Wyniki symulacji pokazały, żestabilność wiązań wodorowych w wariancie zmutowanym jest wyższa. Jego białko wypustkowe tworzy również więcej wiązań z receptorem komórek gospodarza, które utrzymują się przez dłuższy czas. Szacowana szybkość transmisji szczepu B.1.1.7 jest o 70% wyższa, a liczba reprodukcji o 0,4 wyższa niż w wariancie klasycznym.
Zdaniem autorów niebezpieczeństwo kryje się także wże według standardów testowych reakcja łańcuchowa polimerazy z odwrotną transkrypcją lub RT-PCR może nie rozpoznać wirusowego RNA nowego szczepu. Ponadto szczep ze zmienioną mutacją może pozwolić mu uniknąć neutralizacji przez przeciwciała i zmniejszyć skuteczność szczepionek.
Gdzie jest dystrybuowany?
Teraz - praktycznie na całym świecie.Według największej bazy danych genomów GISAID, większość odpowiednich próbek została znaleziona w Wielkiej Brytanii, Danii, USA, Francji, Hiszpanii i Irlandii, istnieją genomy nawet z tak stosunkowo zamożnych krajów, jak Nowa Zelandia i Singapur. Mapy dystrybucji można obejrzeć tutaj.
Przy obecności napięcia w Rosji sytuacja nie jest do końcajasny. 10 stycznia Anna Popova poinformowała o jego odkryciu w kraju. Jednak w największej otwartej międzynarodowej bazie danych GISAID genomów wariantu B.1.1.7. z Rosji nr.
Czytaj więcej
Spójrz na 8 bilionów pikseli obrazu Marsa
Naukowcy opracowali substytut teorii względności. Jaka jest istota „teorii wszystkiego”?
Aborcja i nauka: co stanie się z dziećmi, które będą rodzić