Naukowcy z interdyscyplinarnej grupy badawczej zajmującej się opornością na środki przeciwdrobnoustrojowe (AMR) w
Monitorowanie ścieków pomaga szybko idyskretnie śledzi rozprzestrzenianie się COVID-19. Dodatkowe informacje umożliwiają władzom służby zdrowia śledzenie pandemii na poziomie społeczności. Niedawno fragmenty wirusa SARS-CoV-2 zostały znalezione na obszarach mieszkalnych w Singapurze w ramach proaktywnego programu nadzoru nad ściekami. Informacje te, wraz z kolejnymi testami, pozwoliły Ministerstwu Zdrowia tego kraju na szybką reakcję na sytuację.
Jednak wykrycie wariantów koronawirusa zmonitorowanie ścieków jest mniej powszechne ze względu na problemy z istniejącymi technologiami. Sekwencjonowanie nowej generacji do monitorowania ścieków jest czasochłonne i kosztowne. Testom również brakuje czułości. Międzynarodowy zespół naukowców w ramach nowego badania starał się rozwiązać ten problem.
W badaniu opublikowanym wczasopismo Nauka o środowisku & Technology Letters naukowcy wyjaśniają innowacyjną metodę wykrywania molekularnego opartą na specyficznej dla allelu technologii RT-qPCR, która wykrywa i określa ilościowo wariant B.1.1.7 (Alfa). Opracowany test, przetestowany i zwalidowany na próbkach ścieków z 19 społeczności w USA, jest w stanie wiarygodnie wykryć i określić ilościowo niskie poziomy wariantu B.1.1.7 (Alfa) przy niskiej reaktywności krzyżowej i proporcjach wariantów tak niskich jak 1% w mieszanych Tło wirusa SARS -CoV-2.
Metodę ukierunkowaną na mutacje kolców białkowych, które przewidują wariant B.1.1.7 (Alfa), można wdrożyć przy użyciu dostępnych na rynku protokołów RT-qPCR.
Czytaj więcej
Spowolnienie obrotu Ziemi spowodowało uwolnienie tlenu na planecie
Astronomowie dostrzegają niezwykłe struktury w kosmosie
Zobacz więcej 60 000-letniej sztuki naskalnej neandertalskiej
AMR – Oporność na środki przeciwdrobnoustrojowe
RT-qPCR - ilościowa odwrotna transkrypcja PCR.