Sieć neuronowa wyszkolona do wyszukiwania leworęcznego DNA

Wcześniej naukowcy uważali, że wszystkie cząsteczki DNA to helisy skręcone w prawo, ale później

Po analizie genomu okazało się, że nie zawsze tak jest. 

Niektóre sekcje chromosomów są skręcone w lewonazywane są Z-DNA, a te skręcone w prawo nazywane są B-DNA. Zrozumienie, w jaki sposób chromosomy są skręcone, jest ważne, ponieważ może powodować choroby, takie jak rak, cukrzyca i choroba Alzheimera.

Jednak w diagnostyce istnieją kształty spiralnetrudności: naukowcy nie mają jeszcze dokładnego pojęcia, jak często takie segmenty występują wewnątrz chromosomów, co kontroluje ich powstawanie i jak ich struktura może zmieniać się w czasie. Wynika to zarówno z dużego rozmiaru genomu, jak i trudności w poszukiwaniu regionów Z-DNA.

Aby uprościć to zadanie, rosyjskibioinformatyka. Do jego wyszkolenia wykorzystano informacje o znanych już regionach genów, a także dane o regulacji aktywności genów i syntezy białek w komórkach.

Najbardziej wydajny model oparty na tym typieNaukowcy wykorzystali sieci neuronowe, aby przewidzieć, gdzie w ludzkim genomie mogą znajdować się nieznane jeszcze sekcje Z-DNA. Bioinformatycy mają nadzieję, że w niedalekiej przyszłości będą mogli testować przewidywania i wykorzystywać takie dane do badania roli, jaką odgrywa Z-DNA w organizmie.

Czytaj także:

Nazwany rośliną, która nie boi się zmian klimatycznych. Karmi miliard ludzi

Czujnik do noszenia sygnalizuje, że dana osoba ma COVID-19

Ziemia jest w trakcie szóstego wymierania. Jak to wpłynie na ludzkość