Sieć neuronowa szuka najgroźniejszych mutacji COVID-19

Nowe narzędzie może zapobiec potencjalnie niebezpiecznym wariantom wirusa

jeszcze aktywniej wiążą się z komórkami ludzkimi. Jeśli biolodzy będą wiedzieć z wyprzedzeniem o możliwych mutacjach, ułatwi to ich zwalczanie. 

Ważne jest, aby móc z góry ocenić, w jaki sposóbzmiany aminokwasów mogą zwiększać zakaźność wirusa. Nasza struktura jest potężnym narzędziem do zrozumienia, jak aminokwasy wpływają na zmiany w białku szczytowym SARS-CoV-2.

Tekst badawczy

Autorzy nowego artykułu zastosowali dwuetapową procedurę obliczeniową, aby stworzyć model przewidywania zmian w aminokwasach, cegiełkach wszystkich białek w organizmie.

Zmiany mogą wystąpić w procesie wiązania receptora (RBD) białka szczytowego SARS-CoV-2. Wpłynie to na zdolność wirusa do wiązania się z receptorami ACE2 w komórkach ludzkich i innych zwierzęcych.

W trakcie prac naukowcy przeszkolili sieć neuronowąna danych eksperymentalnych dotyczących aktywności nowego typu koronaawirusa w zależności od zmian w jednym aminokwasie. Odkryli, że potrafią przewidzieć z około 80% dokładnością, czy określone zmiany aminokwasów poprawią, czy pogorszą zdolność SARS-CoV-2 do zakażania ludzi i zwierząt. 

Model przewidywał również, w jaki sposób zmiany w aminokwasach SARS-CoV-2 wpływają na aktywność wariantów alfa, beta, gamma i delta.

Czytaj więcej:

Archeolodzy znaleźli ukryty obszar w starożytnym mieście Majów. Okazało się, że to wyjątkowa cytadela

Eksperci sądowi odnaleźli twarze trzech egipskich mumii

To nie była eksplozja: trzy główne mity o tym, jak powstał wszechświat