AI ajuda a reconhecer resíduos de RNA de vírus antigos no genoma humano

Estudos anteriores mostraram que quando o vírus entra no corpo humano (e de outros animais), ele

 pode alterar o DNA do hospedeiro adicionando parteseu próprio RNA. Sabe-se também que vírus antigos que infectaram a população há muitos anos deixaram por vezes restos do seu RNA no genoma humano. No entanto, encontrá-los revelou-se uma tarefa difícil devido ao enorme número de comparações necessárias para cada vírus “suspeito”. No novo trabalho, os pesquisadores usaram um algoritmo de aprendizado de máquina para resolver o problema.

Para treinar o algoritmo, os cientistas usaram RNA deelementos virais de RNA endógenos não retrovirais conhecidos. Ao treinar o algoritmo do RNA viral moderno, o sistema poderia ter uma ideia de como ele se parece como um todo. Os pesquisadores acreditam que essas semelhanças provavelmente existiam também no RNA antigo. Após o treinamento, os cientistas ajustaram o sistema para prevenir o máximo possível de falsos positivos. Eles então o executaram no genoma humano e encontraram cerca de 100 opções para uma análise posterior. Depois de examiná-los, os pesquisadores descobriram que muitos deles já eram conhecidos e alguns estavam abaixo do limite que definiram como opção de aprovação / reprovação. Eles têm apenas um possível remanescente de um vírus desconhecido restante.

Mais tarde, os cientistas verificaram se encontraram o mesmoRNA viral residual nos genomas de outras espécies, como macacos e chimpanzés. Esta descoberta sugere que a infecção e outras alterações no DNA ocorreram há pelo menos 43 milhões de anos.

Os pesquisadores notaram que mais informações sobre os vírus antigos e seu impacto no genoma humano fornecerão uma visão sobre as nuances do comportamento dos vírus modernos que ainda são desconhecidos.

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