На сегодняшний день коронавирус нового типа стал причиной 3,9 млн смертей во всем мире. В начале пандемии
Agora, um pesquisador de Seattle descobriu arquivos excluídos do Google Cloud que revelam 13 sequências genéticas parciais de alguns dos primeiros casos de COVID-19 em Wuhan.
Последовательности не склоняют чашу весов к одной из многих теорий о том, как возник SARS-CoV-2, или от нее. Например, они не подтверждают теорию об утечке вируса из лаборатории с высоким уровнем безопасности в Ухане. И все же данные говорят о том, что коронавирус нового типа циркулировал еще до того, как была обнаружена первая крупная вспышка инфекции на рынке морепродуктов в провинции Китая.
Para identificar exatamente como e onde aconteceuum vírus, os cientistas precisam encontrar o chamado vírus precursor, do qual todas as outras cepas se originaram. Até agora, as primeiras sequências foram retiradas principalmente de casos no Huanan Seafood Market em Wuhan. Especulou-se originalmente que o SARS-CoV-2 apareceu pela primeira vez no final de dezembro de 2019. No entanto, os casos do início de dezembro a novembro daquele ano não tiveram conexão com o mercado. Isso indica que o vírus se originou de um local diferente.
Casos encontrados no mercado incluem trêsmutações ausentes nas amostras de vírus detectadas semanas depois fora do mercado. Os vírus sem mutações são mais semelhantes aos coronavírus encontrados em morcegos-ferradura. Os cientistas estão confiantes de que o novo coronavírus de alguma forma se originou de morcegos, então é lógico supor que o progenitor também não tivesse essas mutações.
E agora Jesse Bloom do Instituto MédicoHoward Hughes, em Seattle, descobriu que os dados da sequência deletada (provavelmente alguns das primeiras amostras do vírus) também estavam desprovidos dessas mutações.
Cerca de um ano atrás, 241 genéticosa sequência de pacientes com coronavírus desapareceu do Sequence Read Archive, um banco de dados online mantido pelo National Institutes of Health (NIH).
Bloom percebeu as sequências que faltavam,quando me deparei com uma planilha em um estudo publicado em maio de 2020 na PeerJ. Eles faziam parte do projeto PRJNA612766 da Wuhan University e supostamente foram carregados no arquivo. O cientista procurou sequências no banco de dados do arquivo e recebeu a mensagem "Itens não encontrados".
Sua investigação revelou que oas sequências são coletadas pelo Hospital Universitário de Wuhan. Ao mesmo tempo, a pré-impressão do estudo, publicada com base nessas sequências, sugere que foram retiradas de amostras de swabs nasais de pacientes ambulatoriais com suspeita de COVID-19 no início da epidemia.
Bloom não conseguiu encontrar nenhuma explicação para o motivo pelo qual as sequências foram removidas e seus e-mails para os autores do estudo não foram respondidos.
Ученый отмечает, что «нет убедительной научной причины для удаления данных». Дело в том, что последовательности полностью соответствуют образцам, описанным работе. В документе нет исправлений. Кроме того, в исследовании подчеркивается, что образцы получены от людей добровольно, а секвенирование не показывает доказательств плазмидного загрязнения или контаминации образцов. «Кажется вероятным, что последовательности были удалены, чтобы скрыть их существование», — заключает Блум.
Статья с его выводами опубликована на сайте препринтов biorxiv.
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