A ferramenta desenvolvida pela equipe se chama CShaper.
É uma poderosa ferramenta de computação que pode
Segmentar e analisar sistematicamente imagens de células ao nível de representantes específicos.Isso é muito importante para o estudo da divisão celular, bem como das funções das células e genes.Texto de trabalho
Para criar um dispositivo de computação, biólogos estudaram como os animais crescema partir de uma única célula, um óvulo fertilizado, ou através de inúmeras divisões celulares.Em particular, eles queriam saber certas funções dos genes, como quais genes estão envolvidosna divisão de células na formação de diferentes órgãos ou que causadivisões celulares anormais que causam o crescimento dos tumores.
Para fazer isso, os pesquisadores primeiro obtiveram imagens das células - sua "árvore genealógica".Eles então "desligam" (excluem) o gene da sequência de DNA e comparamDuas árvores genealógicas para analisar mudanças nas células e inferir funções gênicas.Depois disso, o experimento é repetido, mas com genes diferentes.
Biólogos usaram embriões no estudoCaenorhabditis elegans é um tipo de verme que compartilha muitas características biológicas com os humanos, por isso pode ser usado para estudar o crescimento de tumores em humanos.
"Dado que C. elegans tem cerca de 20.000 genes, isso significa que seriam necessários quase 20.000 experimentos se você escolhesse um gene de cada vez.Por isso, é extremamente importante utilizar o sistema automatizado de análise de imagens que desenvolvemos." Investigações.
Imagens de células são geralmente obtidas usandodigitalização com um feixe de laser. Os sistemas de análise de imagem existentes podem apenas detectar com sucesso o núcleo da célula, mas a imagem da membrana celular será de má qualidade, o que torna difícil reconstruir a forma da célula.
Além disso, não há um algoritmo confiável para segmentar imagens tridimensionais quadro a quadro (ou seja, imagens quadridimensionais) da divisão celular.A segmentação de imagens é um processo importante em visão computacional que incluiDivida a entrada visual em segmentos para simplificar a análise de imagens.Mas os pesquisadores têm que passar centenas de horas rotulando manualmente muitas imagens de células.
O novo desenvolvimento do CShaper pode detectar membranas celulares, criar formas de células no espaço tridimensional e, mais importante, segmentar automaticamente imagens celulares no nível da célula.
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