Os cientistas estudaram mais de 1.000 combinações de mutações nas proteínas espinho do coronavírus

O SARS-CoV-2 evoluiu para adquirir mutações na proteína spike, a parte do vírus que se destaca da sua superfície.

superfícies e aderem às células parainfecção. Mutações nesta parte do coronavírus aumentam sua capacidade de se ligar a células humanas ou de escapar de anticorpos. Um novo estudo dos Centros de Genômica e Biologia de Sistemas da Universidade de Nova York e da Universidade de Nova York de Abu Dhabi usa modelagem computacional para avaliar o significado biológico das mutações da proteína spike. O objetivo é identificar versões do vírus que se liguem mais fortemente ao receptor ACE2 ou que sejam mais resistentes aos anticorpos.

Crédito: Hin Hark Gan e Christine Gansalus, Departamento de Biologia da NYU.

Os cientistas sugerem que são essas mutações na proteína spike a principal razão para a rápida disseminação do vírus em algumas partes do mundo.

Nos últimos meses, novos e maiscepas infecciosas do coronavírus, levando a novas ondas da epidemia em países como Índia e Brasil. O agravamento da situação requer métodos para a previsão rápida de novas cepas virais infecciosas. Mas acompanhar as novas opções não é uma tarefa fácil; o sequenciamento do genoma mostra que a proteína spike SARS-CoV-2 sozinha, por exemplo, tem cerca de 5.000 variantes possíveis.

Triagem para uma ampla gama de opçõesrepresenta um grande desafio para os métodos experimentais tradicionais, observam os cientistas. A vantagem das simulações de computador é que cem mutações podem ser facilmente estimadas em poucos dias.

Cientistas recorreram a um método computacionalque modela como a proteína spike do SARS-CoV-2 reconhece o receptor ACE2 – uma proteína na superfície de muitos tipos de células – para entrar nas células hospedeiras. Eles avaliaram 1.003 combinações de mutações nas proteínas spike do coronavírus, incluindo aquelas que levaram a um aumento nas infecções no Brasil, África do Sul, Reino Unido e Índia.

Uma avaliação sistemática das opções mostrou queAs mutações de pico que se ligam fortemente ao receptor ACE2 ocorrem em dois grupos, ou "pontos quentes", de mutações na interface de ligação. Eles estão localizados em regiões estruturalmente flexíveis. Isso significa que as mutações que aumentam a ligação reprogramaram com eficácia a conformação da coluna para aumentar sua capacidade de reconhecer os receptores ACE2.

O estudo foi publicado emJournal of Molecular Biology.

Leia também

Drone autônomo Skyborg da USAF faz seu primeiro vôo

Uma enorme mariposa foi encontrada na Austrália. Sua envergadura é de 25 cm

Cientistas transformaram casas de concreto em baterias