A fost creat cel mai complet atlas al genomului coronavirusului până în prezent

O echipă condusă de cercetătoarea ARN Anne Marie Pyle a alcătuit cea mai cuprinzătoare hartă de până acum

structurile genomice ale coronavirusului. Oamenii de știință au cartografiat structurile întregului genom ARN al SARS-CoV-2 folosind celule vii și analize computerizate.

SARS-CoV-2 se bazează pe caracterul său unicStructuri de ARN pentru a infecta oamenii și a provoca boala COVID-19. Dar contribuția acestor structuri la dezvoltarea infecțiilor și bolilor este adesea subestimată chiar de oamenii de știință, spune Pyle, cercetător la Institutul Medical Howard Hughes de la Universitatea Yale.

După toate conturile, dacă ne concentrămpe proteinele codificate în genomul virusului, vom înțelege cum funcționează SARS-CoV-2. Dar pentru aceste tipuri de viruși, structurile ARN din genom pot afecta capacitatea lor de a funcționa în aceeași măsură ca și proteinele codificate.

Anna Marie Pyle, cercetător la Institutul Medical Howard Hughes de la Universitatea Yale

Cercetătorii pot începe acum să-și dea seama cumaceste structuri ajută virusul. Aceste informații ar putea duce în cele din urmă la noi tratamente pentru COVID-19. De exemplu, după ce oamenii de știință au identificat structurile de ARN care îndeplinesc sarcini cheie, va fi posibil să se dezvolte modalități de a le perturba și de a preveni infecția.

Genomul SARS-CoV-2, în număr de aproximativ 30.000 de litereARN neobișnuit de lung pentru un virus ARN. Conversia ARN-ului său în formă 3D oferă SARS-CoV-2 un alt set de instrumente cu care să compenseze un număr limitat de gene. „Virusul ARN beneficiază cel mai mult în ceea ce privește modul în care își folosește genomul”, spune Pyle.

Scanare electronică coloratămicrografie a unei celule (albastru) puternic infectată cu particule de virus SARS-CoV-2 (roșu), izolată dintr-o probă de pacient. Fotografie făcută la NIAID Integrated Research Facility (IRF) din Fort Detrick, Maryland.
Credit: NIAID

Potrivit lui Jeffrey Keeft, StructuralBiolog ARN și virolog la Universitatea din Colorado, oamenii de știință au nevoie de o foaie de parcurs pentru peisajul său genomic pentru a studia orice virus ARN, în special SARS-CoV-2. „Dr. Pyle a creat un fel de atlas global, care este un punct de plecare excelent pentru următoarea rundă de experimentări mai bine orientate”, spune el. „În multe privințe, acest studiu zgârie suprafața bogăției structurii ARN care este probabil să existe în acest virus. Bănuiesc că există multe surprize pentru noi. "

Cartografierea reprezintă, de asemeneaun pas preliminar către noi medicamente care pot viza structurile de ARN ale virusului. Cu toate acestea, călătoria poate fi lungă. Din 2014, când laboratorul său a descoperit o structură nodulară pe care virusurile dengue și West Nile o folosesc pentru a ocoli apărările celulare, Kieft a încercat să găsească o modalitate de a o neutraliza. El avertizează că comunitatea cercetătorilor nu este pe deplin dedicată identificării medicamentelor care perturbă structura ARN. „Această strategie nu a fost studiată și aplicată în același mod ca și pentru proteine”, spune el. Cu toate acestea, atunci când aveți de-a face cu un virus pandemic precum SARS-CoV-2, „încercați totul”.

Citește și

Halo-ul Andromeda se apropie de galaxia noastră. Vă spunem de ce este important

Simptomele coronavirusului la copii. La ce ar trebui să acorde atenție?

S-a dovedit că i-a făcut pe civilizația maya să-și părăsească orașele