AI ajută la recunoașterea reziduurilor de ARN ale virusurilor antice din genomul uman

Studiile anterioare au arătat că atunci când virusul intră în corpul uman (și în alt animal), acesta

 poate schimba ADN-ul gazdei prin adăugarea unei părțipropriul ARN. De asemenea, se știe că virusurile antice care au infectat populația cu mulți ani în urmă au lăsat uneori rămășițe de ARN-ul lor în genomul uman. Cu toate acestea, găsirea acestora s-a dovedit a fi o sarcină dificilă din cauza numărului mare de comparații necesare pentru fiecare virus „suspectat”. În noua lucrare, cercetătorii au folosit un algoritm de învățare automată pentru a rezolva problema.

Pentru a instrui algoritmul, oamenii de știință au folosit ARN dinelemente virale ARN endogene non-retrovirale cunoscute. Prin instruirea algoritmului ARN-ului viral modern, sistemul ar putea avea o imagine a ceea ce arată în ansamblu. Cercetătorii cred că astfel de asemănări au existat probabil și în ARN-ul antic. După antrenament, oamenii de știință au modificat sistemul pentru a preveni cât mai multe falsuri pozitive. Apoi l-au rulat pe genomul uman și au găsit aproximativ 100 de opțiuni pentru o analiză ulterioară. După examinarea lor, cercetătorii au descoperit că mulți dintre ei erau deja cunoscuți, iar unii erau sub pragul pe care l-au stabilit ca opțiune de trecere / eșuare. Au mai rămas doar o posibilă rămășiță a unui virus necunoscut.

Mai târziu, oamenii de știință au verificat dacă au găsit același lucruARN viral rezidual în genomul altor specii, cum ar fi maimuțele și cimpanzeii. Această descoperire sugerează că infecția și modificarea ulterioară a ADN-ului au avut loc cu cel puțin 43 de milioane de ani în urmă.

Cercetătorii au menționat că mai multe informații despre virusurile antice și efectul lor asupra genomului uman vor oferi o perspectivă asupra nuanțelor comportamentului virusurilor moderne care sunt încă necunoscute.

Citeste mai mult

Avortul și știința: ce se va întâmpla cu copiii care vor naște

Radarele au găsit ultimul fort Tlingit din Alaska. Îl caută de peste 100 de ani

O treime dintre cei care și-au revenit din COVID-19 se întorc la spital. La fiecare opt - moare