Instrumentul dezvoltat de echipă se numește CShaper.
Este un instrument de calcul puternic care poate
segmentează și analizează sistematic imaginile celulare la nivelul reprezentanților specifici. Acest lucru este foarte important pentru studierea diviziunii celulare, precum și a funcțiilor celulare și ale genelor.Text de lucru
Pentru a crea un computerdispozitiv, biologii au studiat modul în care animalele cresc dintr-o singură celulă, un ou fertilizat sau prin nenumărate diviziuni celulare. În special, au dorit să cunoască anumite funcții ale genelor, cum ar fi care gene sunt implicate în diviziunea celulară pentru a forma diferite organe sau ce cauzează diviziunile celulare anormale care determină creșterea tumorilor.
Pentru a face acest lucru, cercetătorii au obținut mai întâiimagini cu celule - „arborele lor genealogic”. Apoi „elimină” (elimină) gena din secvența ADN și compară cei doi arbori de descendență pentru a analiza modificările în celule și a deduce funcția genei. După aceasta, experimentul se repetă, dar cu alte gene.
Biologii au folosit embrioni în studiuCaenorhabditis elegans este un tip de vierme care împărtășește multe caracteristici biologice cu oamenii, deci poate fi folosit pentru a studia creșterea tumorii la om.
„Având în vedere că C.elegans are aproximativ 20.000 de gene, ceea ce înseamnă că ar fi nevoie de aproape 20.000 de experimente dacă ai preleva câte o genă la un moment dat. Aceasta va fi o cantitate imensă de date. Prin urmare, este extrem de important să folosim sistemul automat de analiză a imaginilor pe care l-am dezvoltat”, - textul studiului.
Imaginile celulare se obțin de obicei folosindscanarea cu un fascicul laser. Sistemele existente de analiză a imaginii pot detecta cu succes doar nucleul celulei, dar imaginea membranei celulare va fi de calitate slabă, ceea ce face dificilă reconstituirea formei celulei.
În plus, nu există un algoritm de încredere pentrusegmentarea imaginilor tridimensionale time-lapse (adică imagini în patru dimensiuni) ale diviziunii celulare. Segmentarea imaginii este un proces important în viziunea computerizată care implică împărțirea intrării vizuale în segmente pentru a facilita analiza imaginii. Dar cercetătorii trebuie să petreacă sute de ore etichetând manual multe imagini ale celulelor.
Noua dezvoltare CShaper poate detectamembranele celulare, generează forme de celule în spațiul 3D și, mai important, segmentează automat imaginile celulare la nivel de celule.
Citeste mai mult
Încălzirea climatică periculoasă va începe peste 7 ani
Avortul și știința: ce se va întâmpla cu copiii care vor naște
Vedeți cele mai frumoase imagini ale Hubble. Ce a văzut telescopul în 30 de ani?