Oamenii de știință au studiat peste 1.000 de combinații de mutații în proteinele spinului coronavirus

SARS-CoV-2 a evoluat pentru a dobândi mutații în proteina spike, partea virusului care iese din el.

suprafeţe şi se agaţă de celule ptinfecţie. Mutațiile din această parte a coronavirusului cresc capacitatea acestuia de a se lega de celulele umane sau de a evita anticorpii. Un nou studiu de la Centers for Genomics and Systems Biology de la Universitatea New York și New York University Abu Dhabi folosește modelarea computerizată pentru a evalua semnificația biologică a mutațiilor proteinei spike. Scopul este de a identifica versiuni ale virusului care se leagă mai strâns de receptorul ACE2 sau care sunt mai rezistente la anticorpi.

Credit: Hin Hark Gan și Christine Gansalus, Departamentul de Biologie din NYU.

Oamenii de știință sugerează că aceste mutații ale proteinei spike sunt motivul cheie pentru răspândirea rapidă a virusului în unele părți ale lumii.

În ultimele luni, noi și multe alteletulpini infecțioase ale coronavirusului, ducând la noi valuri ale epidemiei în țări precum India și Brazilia. Situația înrăutățitoare necesită metode pentru predicția rapidă a noilor tulpini virale infecțioase. Dar urmărirea noilor opțiuni nu este o sarcină ușoară; secvențierea genomului arată că proteina SARS-CoV-2 spike singură, de exemplu, are aproximativ 5.000 de variante posibile.

Screening pentru o gamă atât de largă de opțiunireprezintă o provocare imensă pentru metodele experimentale tradiționale, notează oamenii de știință. Avantajul simulărilor pe computer este că o sută de mutații pot fi ușor estimate în câteva zile.

Oamenii de știință au apelat la o metodă de calculcare modelează modul în care proteina cu vârf SARS-CoV-2 recunoaște receptorul ACE2 — o proteină de pe suprafața multor tipuri de celule — pentru a pătrunde în celulele gazdă. o creștere a infecțiilor în Brazilia, Africa de Sud, Marea Britanie și India.

O evaluare sistematică a opțiunilor a arătat căMutațiile cu vârfuri care se leagă strâns de receptorul ACE2 apar în două grupuri sau „puncte fierbinți” ale mutațiilor la interfața de legare. Acestea sunt situate în regiuni flexibile din punct de vedere structural. Aceasta înseamnă că mutațiile care cresc legarea au reprogramat în mod eficient conformația coloanei vertebrale pentru a-i spori capacitatea de a recunoaște receptorii ACE2.

Studiul a fost publicat în Jurnalul de biologie moleculară.

Citește și

Drona autonomă Skyborg a SUA face primul său zbor

O uriașă molie a fost găsită în Australia. Anvergura aripilor ei are 25 cm

Oamenii de știință au transformat casele de beton în baterii