Čo je to „britský“ kmeň koronavírusu?
Kmeň 202012/01 je kmeň vírusu SARS-CoV-2, ktorý spôsobuje ochorenie COVID-19. Tento
V polovici decembra sa napätie začalo rýchlo zvyšovaťšírenie. To koreluje s výrazným zvýšením miery infekcií COVID-19 v Spojenom kráľovstve; predpokladá sa, že toto zvýšenie je prinajmenšom čiastočne spôsobené mutáciou N501Y v receptorovej väzbovej doméne vrcholového glykoproteínu, ktorý sa viaže na ACE2 receptor v ľudských bunkách.
Kmeň je tiež pozoruhodný veľkým počtom mutácií v porovnaní so známym trendom mutácií SARS-CoV-2 z decembra 2020.
Kmeň je známy pod niekoľkými menami. Vo vládnej komunikácii a v médiách sa bežne označuje ako „britský kmeň COVID-19“ a „britský kmeň koronavírusu“.
Tento kmeň sa predtým nazýval „prvý kmeňpodľa hodnotenia v decembri 2020 (VUI - 202012/01) zo strany Public Health England, ale Meera Chand a jej kolegovia v správe zverejnenej Public Health England dňa 21. decembra 2020 znížili hodnotenie na Strain of Concern.
V správe napísanej v mene konzorciaGenomics COVID-19 UK (COG-UK) Andrew Rambeau a jeho spoluautori označili tento kmeň ako rod B.1.1.7. CDC tiež nazýva tento kmeň 20B / 501Y.V1.
Krajiny s potvrdenými prípadmi VOC-2020/12/01
Odkiaľ prišiel?
Vraj z Juhoafrickej republiky.Prvú správu o tomto kmeni zverejnila skupina miestnych biológov pod vedením da Oliveiru 22. decembra 2020 - vzorky boli odobraté začiatkom októbra. Pretože nie všetky krajiny majú programy sledovania nových kmeňov, vôbec prvé zistenie v krajine samozrejme nedokazuje, že variant pochádzal z presného miesta, kde sa našiel.
Vlastnosti „britského“ kmeňa
- Genetika
Mutácie vírusu SARS-CoV-2 prebiehajú dosťČasto: Podľa COVID-19 Genomics Consortium Veľkej Británie (COG-UK) bolo nájdených viac ako 4 000 mutácií v samotnom špičkovom glykoproteíne v rôznych kmeňoch tohto vírusu.
Kmeň VOC-202012/01 je definovaný 23 mutáciami: 13 nesynonymných mutácií, 4 delécie a 6 synonymných mutácií (t.j. 17 mutácií mení proteíny a 6 nie).
- Prenosnosť
Britský vedecký poradný orgán NERVTAG(Poradná skupina pre nové a vznikajúce respiračné vírusy) dospela 18. decembra 2020 k záveru, že má miernu dôveru, že VUI-202012/01 je výrazne prenosnejší ako iné kmene, pričom údaje ešte nie sú dostatočné na vyvodenie konečných záverov o základnom mechanizme zvýšeného prenosnosť.
Údaje získané spoločnosťou NERVTAG to ukázalikmeň má "výberový koeficient" 0,70 (70%), za predpokladu generačného intervalu 6,5 dňa. Neskoršia práca používala ako meradlo relatívny počet reprodukcií, ktorý je ukazovateľom výberového koeficientu.
Na základe mierne odlišných údajov bol stanovený relatívny počet reprodukcií („multiplikačná výhoda“) na 1,74 (to znamená, že tento kmeň je o 74 % prenosnejší).
Tento kmeň sa stal dominantným v Londýne ana východe a juhovýchode Anglicka jeden až dva mesiace. Podobný rýchly rast bol pozorovaný v Írsku a zdá sa, že tento kmeň sa čoskoro stane dominantným aj tam.
To isté majú urobiť aj USAv marci. Nárast infekcií SARS-CoV-2 na začiatku nového roka je viditeľný v dôsledku zvýšenej prenosnosti kmeňa, zatiaľ čo výskyt iných kmeňov klesá. To si vyžaduje prísnejšie limity, aby sa zabránilo rýchlemu exponenciálnemu nárastu infekcií. Kontrola prenosu tohto kmeňa zase vyzerá čoraz slabšie.
Prvý obrázok britského kmeňa vírusu
Sú vakcíny proti tomu účinné?
V minulosti bolo vyvinutých niekoľko vakcín COVID-19.
Ako sa však stane viacmutácie, môže byť potrebné vakcínu upraviť. SARS-CoV-2 nemutuje tak rýchlo ako napríklad vírusy chrípky a nové vakcíny, ktoré sa ukázali ako účinné do konca roku 2020, sú typy, ktoré možno v prípade potreby upraviť.
Na konci roku 2020 orgányodborníci na zdravie a odborníci z Nemecka, Spojeného kráľovstva a Ameriky veria, že existujúce vakcíny budú rovnako účinné proti kmeňu VOC-202012/01 ako proti predchádzajúcim kmeňom.
18. decembra 2020 NERVTAG dospel k záveru, že „v súčasnosti nie je dostatok údajov na vyvodenie akýchkoľvek záverov o necitlivosti tohto kmeňa na očkovacie antigény“.
Zatiaľ verejné zdravotníctvoSpojené kráľovstvo potvrdilo, že neexistujú „dôkazy“ o tom, že nový kmeň bude odolný voči vakcíne Pfizer-BioNTech, ktorá sa v súčasnosti používa v britskom očkovacom programe, takže očkovaní ľudia sú stále chránení.
Čo je zvláštne na „britskom“ kmeni?
Všeobecne má „britský“ kmeň 29 mutáciív porovnaní s pôvodným kmeňom Wuhan. To naznačuje, že mutuje oveľa rýchlejšie ako druhá mutácia, pre ktorú virológovia zaznamenali približne dve mutácie mesačne.
Okrem toho sa v proteíne našlo veľa mutáciítŕne nového kmeňa uľahčujú väzbu vírusu na receptory hostiteľských buniek. Vedci preto naznačujú, že kmeň B.1.1.7 bude nebezpečnejší - bude mať vyššiu virulenciu a možno aj schopnosť vyhnúť sa pôsobeniu vyvinutých vakcín.
V novej štúdii sa autori rozhodli použiťpočítačové simulácie na predpovedanie toho, ako rôzne mutácie „britského“ kmeňa ovplyvnia rýchlosť šírenia a závažnosť infekcie, ako aj replikáciu a patogenézu samotného vírusu.
Na vysvetlenie neobvykle vysokej frekvencie mutácií vyskytujúcich sa tak v proteíne S spike, ako aj v N-terminálnej doméne, vedci ponúkajú tri vysvetlenia:
- dlhodobá infekcia vírusom u pacienta s oslabeným imunitným systémom umožnila vírusu mutovať vysokou rýchlosťou;
- adaptívne mutácie začali u zvieracích hostiteľov, preniesli sa na človeka zoonotickým prenosom a pokračovali v ľudskom hostiteľovi;
- selektívna selekcia, ktorá sa vyskytuje v štruktúre vírusu pod tlakom protilátok.
Výsledky simulácie to ukázalistabilita vodíkových väzieb v mutantnom variante je vyššia. Jeho hrotový proteín tiež vytvára viac väzieb s receptorom hostiteľských buniek a tieto väzby pretrvávajú dlhší čas. Odhadovaná prenosová rýchlosť kmeňa B.1.1.7 je o 70% vyššia a počet reprodukcií je o 0,4 vyšší ako v prípade klasického variantu.
Nebezpečenstvo podľa autorov spočíva aj vže podľa testovacích štandardov, reverznej transkripčnej polymerázovej reťazovej reakcie alebo RT-PCR, nemusí rozpoznať vírusovú RNA nového kmeňa. Mutáciou zmenený kmeň mu môže tiež umožniť vyhnúť sa neutralizácii protilátkami a znížiť účinnosť vakcín.
Kde je distribuovaný?
Teraz - prakticky po celom svete.Podľa najväčšej databázy genómov GISAID sa väčšina zodpovedajúcich vzoriek našla vo Veľkej Británii, Dánsku, USA, Francúzsku, Španielsku a Írsku, existujú genómy dokonca z takých relatívne prosperujúcich krajín ako Nový Zéland a Singapur. Distribučné mapy si môžete prezrieť tu.
S prítomnosťou napätia v Rusku nie je situácia úplnejasný. 10. januára informovala Anna Popova o svojom objave v krajine. V najväčšej otvorenej medzinárodnej databáze GISAID genómov variantu B.1.1.7. z Ruska č.
Čítaj viac
Pozerajte sa na 8 biliónov pixelov z Marsu
Vedci vyvinuli náhradu za teóriu relativity. Čo je podstatou „teórie všetkého“?
Potraty a veda: čo sa stane s deťmi, ktoré budú rodiť