Vedci z interdisciplinárnej výskumnej skupiny pre antimikrobiálnu rezistenciu (AMR) v
Monitorovanie odpadových vôd pomáha rýchlo anenápadne sledovať šírenie COVID-19. Ďalšie informácie umožňujú zdravotným úradom sledovať pandémiu na úrovni komunity. Nedávno boli fragmenty vírusu SARS-CoV-2 nájdené v obytných oblastiach v Singapure ako súčasť proaktívneho programu dohľadu nad odpadovými vodami. Tieto informácie spolu s následnými testami umožnili ministerstvu zdravotníctva krajiny rýchlo reagovať na vzniknutú situáciu.
Detekcia variantov koronavírusu smonitorovanie odpadových vôd je menej časté kvôli problémom s existujúcimi technológiami. Sekvenovanie ďalšej generácie na monitorovanie odpadových vôd je časovo náročné a nákladné. Testom tiež chýba citlivosť. Medzinárodný tím vedcov v novej štúdii sa pokúsil vyriešiť tento problém.
V štúdii publikovanej včasopis Environmental Science & Technology Letters, vedci vysvetľujú inovatívnu metódu molekulárnej detekcie založenú na alelovo špecifickej RT-qPCR, ktorá deteguje a kvantifikuje variant B.1.1.7 (Alpha). Vyvinutý test, testovaný a validovaný na vzorkách odpadových vôd z 19 komunít v USA, je schopný spoľahlivo detekovať a kvantifikovať nízke hladiny variantu B.1.1.7 (Alpha) s nízkou krížovou reaktivitou a podielmi variantov len 1 percento v zmesi Pozadie vírusu SARS -CoV-2.
Metódu zameranú na mutácie špičkových proteínov, ktoré predpovedajú variant B.1.1.7 (Alpha), je možné implementovať pomocou komerčne dostupných protokolov RT-qPCR.
Čítaj viac
Spomalenie rotácie Zeme spôsobilo uvoľnenie kyslíka na planéte
Astronómovia spozorujú v hlbokom vesmíre neobvyklé štruktúry
Pozrite sa na viac ako 60 000 rokov staré neandertálske skalné umenie
AMR - antimikrobiálna rezistencia
RT -qPCR - kvantitatívna reverzná transkripcia PCR.