Vedci objavili odtlačky prstov záhadných vírusov, ktoré sa ukrývali v prastarej skupine mikróbov.
Tento týždeň v časopise Nature Microbiologynaraz boli publikované tri články venované vírusom archaea skupiny Asgard. Vedci skúmali genómy vírusov z genomických a metagenomických údajov a študovali ich vzťah s najznámejšími skupinami vírusov. Získané údaje pomohli vedcom uhádnuť, aké presne boli funkcie vírusov, ktoré infikovali asgardské archaea.
Je pozoruhodné, že ide o prvú štúdiuarchaálne asgardské vírusy; predtým sa nič nevedelo. V budúcnosti môže táto línia výskumu ukázať, či a ako sa vírusy podieľali na vzniku eukaryotických buniek na Zemi.
Vo všeobecnosti majú archaea skupiny Asgard veľa génovktoré kódujú eukaryotické proteíny. Vedci ich považujú aj za najbližších príbuzných eukaryotov. Doteraz však vedci nevedeli, či sa podobnosti medzi členmi skupiny Asgard a eukaryotmi rozšírili aj na vírusy, ktoré ich infikujú.
Prvá skupina vedcov analyzovalametagenomické sekvencie. Boli získané z hlbokomorských hydrotermálnych ložísk. Biológovia zhromaždili šesť genómov vírusov, ktoré infikujú archaea skupiny Asgard. Ukázalo sa, že patria k štyrom vírusom, volali sa Fenrir (Fenrir), Sköll (Skoll), Nidhogg (Nidhogg) a Ratatoskr (Ratatoskr). Všetko sú to bytosti zo škandinávskej mytológie.
Na základe genomických údajov biológovianaznačili, že sú schopné semi-autonómnej replikácie genómu, opravy, epigenetickej modifikácie a transkripčnej regulácie. A tiež kombinovať vlastnosti vírusov baktérií a archaea.
Ďalšia skupina vedcov získala kompletný genóm archaeazo skupiny Asgard a znovu poskladali genóm kmeňa LCB_4, ktorý bol považovaný za základnú skupinu kmeňa Odinarchaeota. Biológovia objavili sekvencie dvoch vírusov, dostali mená Huginn a Muninn (Hugin a Munin sú v škandinávskej mytológii pár havranov, ktorí lietajú po svete Midgard a podávajú správy bohu Odinovi o tom, čo sa deje). Vírusy s nimi súvisiace sa našli v genómoch iných prokaryotov vrátane archaea skupiny Asgard.
Tretia práca je venovaná metagenomickému zhromaždeniu 20nové archaálne vírusy asgardskej skupiny zo vzoriek sedimentov. Spojením fylogenetickej analýzy s hľadaním lokusov CRISPR v metagenomických údajoch výskumníci rozdelili nájdené vírusy do troch skupín na úrovni rodiny.
Nakoniec sa výskumníkom podarilo zistiť funkcie iba niektorých vírusových génov. Funkcie veľkej väčšiny génov sú stále neznáme.
Asgard alebo Asgardarchaeota - predpokladanýsuperkmeň pozostávajúci zo skupiny archaea, ktorá zahŕňa Lokiarchaeota, Thorarchaeota, Odinarchaeota a Heimdallarchaeota. Zdá sa, že eukaryoty vznikli v Asgarde, vo vetve obsahujúcej Heimdallarchaeota. To znamená, že archaea zo skupiny Asgardov sú podľa mnohých biológov najbližšie k predkom všetkých organizmov, ktoré majú bunkové jadrá. Mohli prispieť k vzniku zložitého života
Výsledky výskumu nájdete tu, tu a tu.
Čítaj viac:
Pozrite sa na nebeský „Titanic“, ktorý bude poháňať jadrovú energiu
NASA prišla na to, ako hľadať život na Marse: experiment ukázal, kde by mohol byť
Astronómovia našli planéty, ktoré sú odlišné od Zeme, no vhodné pre život
</ p>