K dnešnému dňu spôsobil nový typ koronavírusu na celom svete 3,9 milióna úmrtí. Na začiatku pandémie
Teraz výskumník z mesta Seattle objavil odstránené súbory z Google Cloud, ktoré odhaľujú 13 čiastočných genetických sekvencií z niektorých najskorších prípadov COVID-19 vo Wu-chane.
Sekvencie nenarúšajú rovnováhuz alebo z mnohých teórií o tom, ako SARS-CoV-2 vznikol. Nepodporujú napríklad teóriu, že vírus unikol z prísne stráženého laboratória vo Wu-chane. Dôkazy však naznačujú, že nový koronavírus sa šíril ešte predtým, ako bolo objavené prvé veľké ohnisko na trhu s morskými plodmi v provinčnej Číne.
Presne určiť, ako a kde sa stalovírus, musia vedci nájsť takzvaný prekurzorový vírus, z ktorého pochádzajú všetky ostatné kmene. Zatiaľ najskoršie sekvencie boli väčšinou prevzaté z prípadov na Huanan Seafood Market vo Wu-chane. Pôvodne sa špekulovalo, že SARS-CoV-2 sa prvýkrát objavil koncom decembra 2019. Prípady od začiatku decembra do novembra toho roku však nemali nijaké prepojenie s trhom. To naznačuje, že vírus pochádza z iného umiestnenia.
Prípady nájdené na trhu zahŕňajú trimutácie, ktoré nie sú prítomné vo vzorkách vírusov zistených o týždne neskôr mimo trhu. Vírusy bez mutácií sa viac zhodovali s koronavírusmi nájdenými u podkovárov. Vedci sú presvedčení, že nový koronavírus nejako pochádzal z netopierov, takže je logické predpokladať, že ani predok nemal tieto mutácie.
A teraz Jesse Bloom z lekárskeho ústavuHoward Hughes v Seattli zistil, že odstránené sekvenčné údaje (pravdepodobne niektoré z najskorších vzoriek vírusu) neobsahujú ani tieto mutácie.
Asi pred rokom 241 genetickýchsekvencia od pacientov s koronavírusmi zmizla z online archívu čítania sekvencií, ktorý spravuje Národný inštitút zdravia (NIH).
Bloom si všimol chýbajúce sekvencie,keď som narazil na tabuľku v štúdii zverejnenej v máji 2020 v PeerJ. Boli súčasťou projektu Wuhan University PRJNA612766 a boli údajne nahraté do archívu. Vedec hľadal v archívnej databáze sekvencie a dostal správu „Položky sa nenašli“.
Jeho vyšetrovanie odhalilo, že vymazanésekvencie sa zhromažďujú vo Wuhan University Hospital. Predtlač štúdie zverejnenej na základe týchto sekvencií zároveň naznačuje, že boli odobraté zo vzoriek tampónov z nosa od ambulantných pacientov s podozrením na COVID-19 na začiatku epidémie.
Bloom nedokázal nájsť vysvetlenie, prečo boli sekvencie odstránené, a na jeho e-maily autorom štúdie neodpovedali.
Vedec poznamenáva, že „neexistuje žiadny presvedčivý vedeckýdôvody na vymazanie údajov." Ide o to, aby sekvencie plne zodpovedali vzorom opísaným v práci. V dokumente nie sú žiadne opravy. Štúdia navyše zdôrazňuje, že vzorky boli získané dobrovoľne od jednotlivcov a sekvenovanie neukazuje žiadny dôkaz kontaminácie plazmidom alebo kontaminácie vzoriek. „Zdá sa pravdepodobné, že sekvencie boli odstránené, aby sa zakryla ich existencia,“ uzatvára Bloom.
Článok s jeho zisteniami vyšiel na webe biorxiv preprint.
Čítaj viac
Najväčšia kométa v histórii je vidieť v slnečnej sústave: je to takmer planéta
Nová metóda okamžite zmení uhlík na grafén alebo diamanty
Našiel sa lacný spôsob, ako zachrániť centrá megacities pred prehriatím