V novej práci autori vytvorili neurónovú sieť, ktorá určuje, akú formu bude maťTento alebo ten proteín
Tvar proteínu sa teraz počíta pomocouurýchľovač častíc, ktorý dáva trojrozmerné fotografie molekúl bielkovín, alebo pomocou superpočítača, ktorý počíta ich štruktúru v súlade so zákonmi chémie a kvantovej fyziky.
Autori vytvorili algoritmus nazývaný evoformer, ktorý sa pokúša určiť štruktúru jednotlivých segmentov proteínových molekúl tým, že ich reprezentuje ako trojrozmerný strom grafov, matematickú abstrakciu, ktorá pozostáva z zo súboru objektov, ktoré sú navzájom spojené v pároch.navzájom, spoliehajúc sa na už známe príklady a postupne sa meníštruktúra pripojení a umiestnenie uzlov, ktoré sa blížia k optimu.
Ďalej skombinovali takéto algoritmy a vytvorili neurónovú sieť AlphaFold2 .
Minulý rok sme v rámci súťaže CASP13 predstavili prvú verziu nášho systému AlphaFold, ktorý dokázal predpovedať štruktúru proteínov s takmer atómovou presnosťou.Teraz sme vytvorili jeho novú verziu, ktorá je z hľadiska rýchlosti a presnosti výrazne lepšia ako všetci konkurenti.Jeho zdrojový kód je zároveň úplne otvorený.
Demis Hassabis, generálny riaditeľ spoločnosti Deepmind
Výsledkom je, že neurónová sieť rekonštruuje trojrozmerný tvar s atómovou presnosťou s chybou 0,096 nanometra pre každý atóm vo vnútri proteínu asi za 10 minút.
Čítaj viac:
Vysvetlil, ako sa vesmír odráža v blízkosti čiernych dier
Hromadná otrava a nové verzie smrti civilizácie: ako sa zmenili naše vedomosti o Mayoch
Zmeny na obežnej dráhe Zeme prispeli k vzniku zložitého života na planéte