Nový softvér nájde baktérie odolné voči antibiotikám, ktoré infikujú ľudí a zvieratá

V novej štúdii tím odborníkov skúmal veľkú komerčnú hydinovú farmu v Číne a zhromaždil 154

vzorka zo zvierat, jatočných tiel, robotníkov, ich domácich miláčikovfarmy a životné prostredie. Zo vzoriek izolovali špecifické baktérie Escherichia coli (E. coli). V ľudskom čreve môžu žiť úplne neškodne, ale môžu byť aj patogénne. A ak ich genóm nesie gény pre odolnosť voči určitým liekom, môže to viesť k rozvoju vážnych chorôb vrátane ťažkých žalúdočných kŕčov, hnačky a vracania.

Výskumníci použili výpočtový prístupktorý kombinuje strojové učenie, sekvenovanie celého genómu, siete zdieľania génov a mobilné genetické prvky na charakterizáciu rôznych typov patogénov nachádzajúcich sa na farme. Zistili, že antimikrobiálne gény (gény, ktoré udeľujú rezistenciu voči antibiotikám) sú prítomné v patogénnych aj nepatogénnych baktériách.

Nový prístup využívajúci strojové učenieumožnilo odborníkom odhaliť celú sieť génov spojených s antimikrobiálnou rezistenciou, ktorá je spoločná pre zvieratá, farmárov a životné prostredie. Táto sieť zahŕňala gény, o ktorých je známe, že spôsobujú rezistenciu na antibiotiká, ako aj zatiaľ neznáme gény spojené s rezistenciou voči liekom.

Zastavané prostredia, ako sú oblastiIntenzívna živočíšna výroba sa považuje za ideálnu živnú pôdu pre baktérie rezistentné na antimikrobiálne látky a gény rezistencie na antibiotiká. Ich štúdium má veľký význam pre účinnú liečbu niektorých chorôb a infekcií.

Čítaj viac

Po stáročia sa loví: čo vieme o planéte Vulcan vedľa Slnka

Fyzici experimentálne potvrdili nový základný zákon pre kvapaliny

Astronómovia našli zdroj záhadných rádiových výbuchov, ktoré prichádzajú z vesmíru