Autori vyvinuli miniprotilátky pomocou softvéru, ktorý predpovedá ako
Toto je veľmi úžasná vec! Otvára veľa možností.
Stephen Mayo, chemik v Caltech
Protilátky sa dobre viažu na bielkoviny, napr.s rôznymi mikróbmi. Preto ich farmaceutické spoločnosti používajú ako lieky na boj proti infekciám a rakovine. Ale protilátky sú veľké proteíny, takže ich výroba je drahá a proces je často nestabilný. Autori štúdie pracovali na prekonaní týchto problémov.
Proces, ktorým sa protilátky viažu na cieľvyzerá ako horolezec, ktorý sa pokúša vyliezť na strmý útes, vysvetľuje David Baker, výpočtový štrukturálny biológ z University of Washington (UW). Povrch takejto skaly je zvyčajne hladký a má malú oporu pre ruky a nohy. Protilátky sú veľké, takže dokážu urobiť veľa úchopov súčasne a pevne držať.
Ale miniprotilátky majú menej možností.Výskumníci sa pokúsili prekonať tento nedostatok; identifikovali zachytávacie miesta na proteínoch a na základe toho vytvorili miniprotilátky. Ale toto funguje len pri dobre preštudovaných proteínoch.
Aby ste tento problém obišli, Baker a kolegoviaobrátili na softvér Rosetta, ktorý vyvinuli na predpovedanie proteínových štruktúr na základe ich aminokyselinovej sekvencie. Aby sa vytvorila mapa potenciálnych oporných bodov, tím dal programu za úlohu vypočítať, ako presne definované aminokyseliny sa viažu na rôzne body na povrchu cieľového proteínu. Výskumníci použili Rosetta na vytvorenie desiatok tisíc virtuálnych mini-protilátok.
Tento softvér to umožnívýskumníkov, aby vyvinuli diagnostické sondy, ktoré pomôžu odhaliť choroby v ranom štádiu, dodáva Tanya Kortemme, bioinžinierka z Kalifornskej univerzity v San Franciscu.
Môžeme navrhnúť proteínykontaktovať akýkoľvek cieľ. To znamená, že miniproteíny môžu nielen blokovať proteíny spôsobujúce ochorenie, ale aj nasmerovať lieky do rakovinových tkanív alebo dopraviť svetlo vyžarujúce alebo rádioaktívne diagnostické molekuly do akýchkoľvek buniek. To pomôže sledovať pokrok v liečbe.
Longxin Cao, postdoc
Čítaj viac:
Existuje „piaty prvok“: nový experiment potvrdí, že informácie sú podstatné
"James Webb" urobil najjasnejšiu fotografiu hviezdy v histórii
Kvantové nabíjanie umožní rekordne rýchle nabíjanie elektromobilov